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MiRNA芯片
. \. V* o7 n9 g# C4 dExiqon
8 Z4 G. C& q. rmicroRNA人，小鼠，大鼠芯片
5 w/ f s/ H( f+ C. t* q* 覆盖miRBase 数据库人，小鼠，大鼠三物种全部microRNA，人（约847条），小鼠（约609条），大鼠（约351条）
( D% Y/ s- R/ v }* 覆盖与上述三物种相关的所有病毒的microRNA
: {( e1 F0 Y! L6 _! S* 428个Exiqon特有的miRPlusTM捕获探针，提供miRBase 数据库之外的microRNA预测信息。miRPlusTM捕获探针对microRNA预测的准确性高，在现有的miRBase 数据库中，有30%的microRNA与miRPlusTM探针所预测的序列一致
* k" O! ?' D4 S& s% Z& i* F' P* 芯片内超过1700个miRNA捕获探针，并且每个探针重复4次( S/ B$ V1 v2 P3 J: e
* 8个阴性对照探针，26个小核RNA阳性对照探针5 z4 ?' Q9 {) z2 q$ i
' ^* J5 f& G$ |; [* GmicroRNA全物种芯片
* w4 e+ h5 O. w: J* 覆盖的miRBase数据库内除人，大鼠，小鼠及其相关病毒之外的全部物种（包括脊椎动物，无脊椎动物，植物，病毒等）的所有microRNA
7 _$ q' L' @, F+ F* 芯片内超过2500个miRNA捕获探针，并且每个探针重复4次, Z4 _; A- A' n5 y
* 8个阴性对照，26个小核RNA阳性对照探针
* L6 j# U2 @) f1 D" R4 S1 ?, g: V2 H2 l* z" u# X
联川6 S1 M* a, C; l# X0 }) `
100% Sanger microRNA 14.0版探针信息 ) F% P0 P6 E+ F( G! X ~
全球首家提供最新Sanger 14.0版microRNA微阵列检测服务。我们的标准microRNA微阵列芯片可对最新版数据库报道的包括人、大鼠、小鼠、斑马鱼、鸡、猪、水稻、玉米、拟南芥、病毒等在内的所有单个物种或是同类物种组，如哺乳动物、植物等，microRNA进行检测，并提供完整的数据分析。 6 Q6 z/ I/ U2 N. l& _
% e+ t. H0 w7 j2 R9 ?
高度灵活的探针序列 # y" g7 F2 O! n! v0 \) [
基于创新的µ araflo® 芯片合成技术（原位合成），我们能够完全按照您的要求进行阵列合成。在我们的标准 microRNA微阵列上，您可以免费添加100条定制序列探针（长度≤25nt）。我们也提供完全定制微阵列服务，满足您进行预测序列验证，新型small RNA发现等研究的需求。 2 o% Y% Y( x* s
$ f( t3 @- [5 l微流体微阵列平台
, V5 d9 l& S% }6 l& Z创新的μParaflo® 技术将高通量并联合成技术，微流体技术以及数字光化学合成定制阵列技术融为一体。凭借此项技术，我们可提供双色标记微阵列芯片（2个样品/芯片）和单色标记微阵列芯片（1个样品/芯片）以满足您不同的研究需求。不仅如此，运用这一领先的微阵列平台，我们可为您提供相比于传统点样阵列更为可靠更为优异的实验结果。
+ f' c" ^6 v' }2 s& Z' S+ I+ b7 ?8 y4 E, b. U
严格的质量控制标准 7 Y; D3 |, f) C& V
运用μParaflo® 技术进行原位合成芯片，可确保合成高质量的探针，并可进行高严谨性的过程控制。运用此项技术获取的微阵列实验数据是高度可信并且是可重复的。您可采用Real-time PCR和Northern Blot进行验证。
: p' U, f$ w: P5 I% q; R7 X5 O1 |$ Y; Z9 b) x
高质量的数据结果
5 \$ b7 o8 ?2 I" g0 S" b4 b我们的阵列平台性能优异，噪音信号被控制在极低的水平，因而可揭示出样品中真实的生物学差异。我们服务的客户已发表了大量的高水平文章。截至目前，客户已发表73篇论文，其中Nature4篇，Science1篇。
1 N$ E- j6 \+ |5 t+ ?2 x
. l+ N: C8 a t. c L6 @' b7 ]$ {, l高效经济的“一站式”解决方案 : G- Q' X, L! x% v3 D. c6 p
全方位的microRNA表达谱分析服务包括从总RNA到数据报告的一站式服务，为你节省大量的时间、精力和实验材料。0 T- H: u" x, u6 I* `, I* D
3 l. D2 k8 A- u+ k( T& p
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# E$ Y( z9 ]5 j% \ j3 P2009年3月9日，Sanger microRNA数据库(miRBase)升级至14.0版。
) g* M8 b. o+ ^
7 q: A: Q7 E: K/ [& F2009年9月15日，Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至14.0版。随着1580条新的成熟miR和miR*序列的加入，miRBase数据库中收录的microRNA序列信息已超过10,000条。新版本共收录10,581条成熟miRNA序列信息，通过验证的microRNA发夹前体从9,539条增至10,883条，共涵盖115个物种。 - p; J- U6 {" |; q, w7 _
& K4 F" X5 b% I
新增microRNA序列主要集中在以下物种：7 m7 n3 a, g5 ^
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1. 模式生物－Homo sapiens (人，新增15条，共721条)，Mus musculus (小鼠，新增32条，共579条)，Rattus norvegicus (大鼠，新增39，共286条)，Danio rerio (斑马鱼，新增24条，共360条)，Drosophila melanogaster (黑腹果蝇，新增5条，共152条)，Bombyx mori (家蚕，新增36条，共91条)，Caenorhabditis elegans (秀丽隐杆线虫，新增19条，共174条)，Arabidopsis thaliana (拟南芥，新增3条，共190条)
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2. 重要的农业作物(共新增280条miR序列)：Arabidopsis thaliana (拟南芥)，Glycine max (大豆)，Oryza sativa (水稻)，Zea mays (玉米)，Sorghum bicolor (高粱)，Medicago truncatula (蒺藜苜蓿) ! N- n: X1 d' e! j1 i
) l) X2 M1 q) K6 P9 b3. 病毒(新增30条miR序列) 7 I8 ~9 d* e7 C0 c* \' X
6 G9 e0 ^3 K7 S8 C l! a除此之外，新版microRNA数据库第一次报道了10个物种的microRNA信息，它们是：Equus caballus (野马)，Daphnia pulex (蚤状溞)，Phaseolus vulgaris (菜豆)，Malus domestica (苹果)，Brachypodium distachyon (二穗短柄草)，Aquilegia coerulea (洛矶山耧斗菜)，Populus euphratica (胡杨)，Herpes B virus (乙型疱疹病毒)， Infectious laryngotracheitis virus (传染性喉气管炎病毒)，Herpesvirus of turkeys (火鸡疱疹病毒)。' M) R6 B E5 t
. z/ |6 }: ^5 I5 N
Affymetrix
' b' n8 s; `+ u+ k9 iAffymetrix miRNA芯片在一张芯片上覆盖了多个物种，包括拟南芥、水稻、玉米等重要植物模式生物，序列信息源于sanger miRNA数据库v11.0及小分子RNA
O, _6 t C0 \6 O" w
$ Q( V! f% o% _, j3 ^% `. n( r' G安捷伦* S$ T1 G. D! j' ]: u' L* x1 W
Agilent microRNA芯片技术特点
$ H" t" ]2 F8 r9 m& c$ I7 T: @" U. C2 K/ [2 j7 F# p
1、唯一能区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台； 5 m. P& C+ m0 b% I& n
2、无需分离miRNA，直接用Total RNA 进行实验；1 S1 p: a2 N0 ^3 g/ J- c
3、只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验(不含质检所消耗的量)， 避 免了分离、富集、放大等过程带来的影响；
- x, z2 F0 t7 U3 ^8 F# a4、样品适用范围广：组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验；
- b M" M$ }/ D' U0 U9 [: {* s5、高特异性：特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异；
$ `5 o* K5 j! U' m/ v+ l% j6、高灵敏度：检测丰度跨4个log，最高可达6个log，只要存在6000个拷贝的分子就可以检出；
0 J) q+ P5 U9 S4 c# O7、数据来源于Sanger 13.0版本，并方便及时更新；
2 d/ U9 d$ i1 o+ y' b8、人、大鼠、小鼠之外的物种，可以方便的通过earray进行个性化定制。
: Z+ z/ ?' y* J- g* y3 ~
* D3 }: K" Q, W. v7 WIllumina
# ?7 M6 F, b1 q, Q- {* t7 `3 JIllumina microRNA表达谱基因芯片特点：* c$ c- e; _9 w9 A% u0 `
*样本量低：单次反应仅需200ng总RNA；' w( P) z8 U1 n( o; ^4 O8 [* Z( L
*高通量：一次可进行12个样本或者96个样本的芯片试验；) j) r" ]8 h' E4 p9 k
*最低检出限度：1*104分子；
' c0 B' e" Q9 I( q*表达差异检测范围：≤1.3倍；7 |' t: @9 Z" K$ T5 M! |0 T6 r( M
*通量范围：〉2.5logs；3 f$ r2 j/ ?2 c5 e" x' m
*重复性指标：R2≥0.97。
2 E0 B9 r3 w* k' x# c 人microRNA基因芯片 小鼠microRNA基因芯片* Y4 r: c$ l5 t7 ?; k
microRNA 基因数量 1146个基因 656个基因
+ X h3 c }) M9 K7 P( n信息来源 sanger miRBase,V 12.0.Febraury 2007 release sanger miRBase,V 12.0.Febraury 2007 release! x$ s9 @) a" X D+ ~" H
样本数量 12或96个样本 12或96个样本
, J' f* d4 `9 C% Z0 G芯片重复性 ≥97% ≥97% |
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总评分: 威望 + 2
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发表于 2010-11-18 16:32
