大家在做miRNA的下调（microRNA loss-of-function）时用哪种方案

runsong

fantafiction

不懂

274996064

这主要是根据你的实验的需求来说的，你要是希望一直都是下调的就要用到载体
) H/ i; Q* X" H4 |+ E" O要是只是瞬时的下调用单链的RNA就可以 各有各的用处

runsong

回复 274996064 的帖子# s  w  \* d0 o6 S8 J8 ]
/ A# N) B+ Q' J0 b/ f& H
我想一直下调，请问你们用什么载体呢？

274996064

psilence 3.0    我们的载体是从别的实验室拿的

libingnan11

这个microrna的下调可以直接去公司合成，不过我们用的psuper质粒， psilencer 也可以

jkfly

从方便和实用的角度肯定是miRNA海绵好啊，我自己做觉得这个好

茅草无敌

我想问问那个miRNA海绵是什么啊
+ P2 H9 @( L3 }+ E3 E

fengjh100

在基因功能研究中，最有效的方法是阻止特定基因的功能，然后了解其后果。miRNA同样如此。, ]1 V9 \( }& S' A7 r) G: I

8 G( A4 v4 [) n( W# c4 S然而，相比之下，miRNA的功能研究要困难得多。为什么？首先，miRNA没有蛋白产物，这使得研究复杂化。其次，miRNA的生物发生有多个步骤。最初的转录本为pri-miRNA，它在细胞核中加工形成前体pre-miRNA。这个茎环结构的RNA输出到细胞质，被Dicer酶进一步加工，最终形成了成熟的miRNA。成熟的miRNA没有poly(A)尾巴，因而检测起来要颇费一番心思。
" m" Q( V3 g) G! I% @' G
# U1 H; ]( C: t- W( u3 T2 x+ s除了检测，miRNA的功能丧失（loss-of-function）研究也是难题。标准的RNAi技术行不通。成熟的miRNA与siRNA不相容，因为它们两者都能进入RISC复合物；pre-miRNA是茎环结构的，siRNA无从下手；pri-miRNA貌似是siRNA最容易靶定的，但一个是细胞核，一个在细胞质，好似牛郎织女，无法见面。& D9 `" K/ n9 ^7 p+ b( a
6 p  I  m! K3 {
当然，科学家们也不是束手无策。miRNA不是能与互补的mRNA结合吗？他们就开发出与miRNA互补的寡核苷酸，作为mRNA结合的竞争性抑制剂。这些抑制剂实现了短期分析，在细胞培养物以及某些动物实验中都获得了成功。但是，如何实现miRNA的长期抑制？+ q* w5 l, b( Q" s& p

, P/ |2 P& h6 t5 b% _2007年，麻省理工大学的Phillip Sharp及他的同事利用相似的原理，开发出一种长期抑制miRNA基因的高效方法1。他们称之为miRNA海绵（miRNA sponge），意思是吸满了miRNA，这样它就无法与天然靶点结合。miRNA海绵是一条mRNA，其3’ 非翻译区（UTR）包含若干个miRNA靶定位点（如下图）。更重要的是，这些靶定位点在RISC切割位点有一些错配。这样，抑制剂mRNA就不会被降解，而与RISC稳定结合，让它远离天然的mRNA靶点。