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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑
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这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。/ r# j: _- ^, h: A7 x( o
我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。) n2 _$ M0 I9 g
TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess 8 z3 C- E. r3 A8 q) M6 D8 j
最简单的用法如下- B# S9 a6 ?8 ], k- @6 w4 K) {' y
如图1：打开网址后，点击 site search
% e' H% o. t" ~5 T1 y' K! n如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit; g; [3 z; V+ w. Y; z
如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。9 D5 n h- m; G& V# K
如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
# G" E% m8 n! J( M7 ~8 G0 v8 _% v4 b0 Y6 Q6 ]" [2 N
其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
发表于 2012-9-24 08:16
