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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑
( j. n4 C% Z9 _4 \5 ]; L
+ f) i) ` X4 q/ w这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。- b9 }6 _+ \, H# n5 m% C' r9 H8 G3 W8 d
我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。 C( O7 x& X. E, l. u4 L& W
TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess 3 G( u% R i$ e0 |! K2 c& M$ A
最简单的用法如下
2 n" P- l3 O" w5 _+ q如图1：打开网址后，点击 site search( [3 Q F) I3 r: s# K% c/ y. E
如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit
! T8 a* ] z/ j0 D2 Z/ n如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。5 c$ Z& l7 B/ V
如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
: e$ x/ x% i* `6 D9 \& Y6 f
3 s* q! u: z J8 F其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
