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楼主: runsong
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大家包装的慢病毒滴度是多少(不包括浓缩)   [复制链接]

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楼主
发表于 2012-3-7 20:33 |显示全部帖子
我差不多是10的6左右,浓缩之后基本达到10的8,凑合用~
+ G: N& ?( `6 e7 P* A. u$ l转录本里面要是有miRNA什么的,会导致包装效率下降,因为有一些本来可以包到病毒里的RNA被裁减碎掉。如果没有会被剪掉的元件的RNA的话,要是比较小的插入片段,估计应该有10的7左右吧。3 ]" D4 V4 G: D0 P% u) g
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沙发
发表于 2012-3-24 23:19 |显示全部帖子
回复 sj03572001 的帖子* p$ y* @: z" [& E* R* r
+ x4 ?& T. I4 x+ e) M. M
我是VSVG, delta-R8.91 和pGIPZ三质粒系统。我不知道是不是invitrogen的,因为是从我们实验室别人那里要的体系。protocol不方便给你原版,因为是别人整理的。但我可以说个大概。就是,用10cm dish 满的293T一盘传4盘(10ml培液),这4盘都不加双抗,培养24小时,大概达到50-80%覆盖率。这时候做个类似于lipo2000的转染,按标准的lipo的protocol转。就是一只管子加optiMEM和lipo,一只管子加potiMEM和质粒(VSVG:R8.91:pGIPZ=1ug:3ug:4ug,对于10cm大盘),之后混合,放置15分钟,再滴加到细胞里。12小时后换液换成有双抗的培液(DMEM加10%血清),之后36小时收一次病毒,再换液,再24小时后收一次。大致流程就这样。我觉得最关键的就是转染效率,建议你用个GFP的质粒先摸转染条件,主要就是lipo加多少,质粒加多少。效率要90%以上GFP阳性才行。
$ s5 C3 @! G$ _. a如果你包装的是shRNA或者miRNA的序列,这种病毒滴度本来就不容易做的高,因为有些RNA自己会被切断,而没法包装成病毒。只有幸存的RNA才会包到病毒里。$ s" e, n: G! R% U, }# M
祝顺利!
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藤椅
发表于 2012-3-25 14:52 |显示全部帖子
回复 huangcong1988 的帖子# |0 k) `. O( M6 ~3 S5 {2 B: [8 z

$ ^+ R! O8 O9 O$ U& J1 [' S% y2 u浓缩后加的培养基可以是你转染的对象细胞的培养基呀。如果你足够猛,就直接把这种浓缩过的东东当作培养液加到吸走培液的细胞里,那就浓到了极限了吧~
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板凳
发表于 2012-3-28 14:50 |显示全部帖子
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回复 huangcong1988 的帖子
. L+ {: I+ H3 F) S4 c8 F, Y( t+ F
按这样说来,确实是被稀释了。
4 I, k1 a# x- c8 e& J* b不过,通常我是这样认为的:
) l& l7 F/ T) c( p  G, T一开始没浓缩时,假设体积是100毫升,5 F2 F# ^' G" H: ~/ q
浓缩后,变成一个坨坨,* N% x, b# `  h, U7 m: |
把这个坨坨用1毫升的溶液给溶解了,5 J6 k! K  `' C2 ^# h
假设病毒没有损失率,那么就算是“浓缩”了100倍。因此用我的观点看,是“浓缩”了。
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报纸
发表于 2012-3-28 14:52 |显示全部帖子
回复 salomemao 的帖子- U7 \  Z6 {; ]) E0 W

. L1 q- s; M& N4 N# w/ Q; a& ^转染三质粒的时候,我们实验室的protocol是不加双抗的,据说双抗会影响我们的体系的转染效率。原因我也不知道。之后十二小时后我们认为质粒已经进到细胞里面了,所以再加上双抗防止污染。
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地板
发表于 2012-3-28 20:57 |显示全部帖子
回复 salomemao 的帖子- w, @. l3 a2 `9 l! `

7 F1 G( r0 z: U2 }$ p是啊,让你见笑了 :)

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发表于 2012-3-29 12:32 |显示全部帖子
回复 huangcong1988 的帖子0 T. i% Y/ @$ f& X& u# h; }- |2 A

3 Y, \' j% V4 l  y0 p9 m我是用50毫升离心管,PEG6000和浓NaCl来浓缩,低速离心。一次可以离35ml,最后溶在400微升里面,扣除损失,估计浓缩应该在80倍左右。我还用超速离心法浓缩过,那个方法得到的坨坨很少,因为坨坨主要是血清里的蛋白,超离的时候很少下来。超离我是37毫升最后可以溶在大概200微升甚至更少。
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发表于 2012-3-30 21:25 |显示全部帖子
回复 salomemao 的帖子8 r0 q5 H' Z4 ^8 H+ E6 K
( U; l4 G6 H  Z1 |: R/ f

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发表于 2012-6-5 13:28 |显示全部帖子
回复 huangcong1988 的帖子
; ^# M; T( y- Q9 C7 H$ E- A) Z) H# Q- g3 H& b
是的。
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