怎么查一段DNA序列是否含有重复序列？

echowdk

有哪个软件或者网站可以查一段已知的DNA sequence是否含有重复序列，或者更详细的序列信息？

john7812x

你是要确定某基因在基因组中的拷贝数吧。% w! l- z7 S, e7 u5 o: g
基因拷贝数可以通过：1，Southern Blot法；2，荧光定量PCR方法，等来确定。而不是生物学软件的分析。
( `) o' l( f5 }$ Y, Y. Y' f现提供一篇用Southern Blot方法确定拷贝数的英文文献供参考，其他方法你可以到网上查。
& w" \9 T, {) j) ~) ]- d
7 e$ r; N% W0 l3 i, H Identification of ribosomal phosphoprotein P0 of Neospora caninum as a potential.pdf (1.21 MB)

2011-11-10 18:30 上传

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7 k, D7 K5 u" V
. T4 E) d, h' l  D# m, }3 f

zzc2211

DNA Star,我用这个，但我们干的工作可能不一样

echowdk

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/ @; J, d+ V3 H  K% _" Y
' @; @, C# s3 M) J" }& g是啊。我是想做southern blot，设计探针。原来探针设计的要求还挺高的，所以想分析一下。

langziforever

回复 echowdk 的帖子/ _9 o2 z9 r8 @  d! {7 s" U" X, `

3 i% L1 z( {7 R' z设计探针很多都可以的，你是想找回文序列和二级结构的吧？我们以前用DNAclub，primer5这些，都可以，你甚至可以去找一些在线设计引物的网站，都可以实现这个要求的！

echowdk

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$ C. s- D& d3 ?! R. Q- h) w. c! `/ t, I/ Y, k3 |9 `
哦，谢谢啊~

yyshpy

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7 q2 r; w$ V! \3 I2 K1 s/ {2 I2 t
学习了