怎么查一段DNA序列是否含有重复序列？

echowdk

有哪个软件或者网站可以查一段已知的DNA sequence是否含有重复序列，或者更详细的序列信息？

john7812x

你是要确定某基因在基因组中的拷贝数吧。" K7 b% A1 _6 g4 `( H
基因拷贝数可以通过：1，Southern Blot法；2，荧光定量PCR方法，等来确定。而不是生物学软件的分析。
* v( N' h3 Z  E, o5 B现提供一篇用Southern Blot方法确定拷贝数的英文文献供参考，其他方法你可以到网上查。
/ C. b1 e, ~8 T6 G6 K3 ?
9 Y' @/ d1 `7 M+ @: B Identification of ribosomal phosphoprotein P0 of Neospora caninum as a potential.pdf (1.21 MB)

2011-11-10 18:30 上传

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1 P. @2 E5 I- j" H
6 O, c' w$ L: m+ k+ N

zzc2211

DNA Star,我用这个，但我们干的工作可能不一样

echowdk

回复 john7812x 的帖子4 ^, o2 q( L+ x/ F9 m8 y
  W5 u% N8 `' i4 ~! ~* Q, w/ Q+ b
是啊。我是想做southern blot，设计探针。原来探针设计的要求还挺高的，所以想分析一下。

langziforever

回复 echowdk 的帖子% Q& C, @; Y2 O; |

" P) G* \5 t5 S) N设计探针很多都可以的，你是想找回文序列和二级结构的吧？我们以前用DNAclub，primer5这些，都可以，你甚至可以去找一些在线设计引物的网站，都可以实现这个要求的！

echowdk

回复 langziforever 的帖子$ `- I+ W4 A* d' E
5 x* {6 b0 [! n. q
哦，谢谢啊~

yyshpy

回复 john7812x 的帖子1 K/ k- _  d6 z' k/ g. n* n9 C, Q

4 R6 H' j) R( I% l: @" y学习了