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求设计引物 [复制链接]

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楼主
发表于 2011-12-17 10:59 |显示全部帖子 |倒序浏览 |打印
有一个基因在NCBI上没有全长的mRNA序列,只能找到部分CDS序列,设计了好几次了,PCR的结果都有杂条带……该基因家族同源性挺高的+ a. T7 e, {) ~" i/ u, m) a
; Z6 F/ X* V; \. P0 ]/ W
麻烦哪位高手帮忙设计一条引物,引物要求片段最好不要太长。
/ _) S+ l6 r! @3 x& ^. x  h, p8 Q6 L& i3 E8 b# `2 T* ~
NCBI上CDS序列链接http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EU862290.1
% z2 x, G7 F7 w& [& m
2 c: \; j1 [* l! }) D大鼠SOX3* @2 g; \$ P/ P  d

9 W: l: h& N% ?$ O9 P9 T4 w非常感谢……
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沙发
发表于 2011-12-17 14:20 |显示全部帖子
回复 wangzhiqi86 的帖子
. {2 w3 {1 j- r) H& X1 J( ^% [2 l
) P  r& |$ s0 I6 p( Z" X非常感谢……我试试。
6 {  i2 F# s2 A  g- y1 r. w) ~4 [5 ]  A$ k- N  i' W

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发表于 2011-12-17 14:21 |显示全部帖子
回复 cellbuddies 的帖子
7 A5 A, [  |; ]9 i6 U. t5 f6 G" c6 i6 a2 b  }+ B- `
GC rich什么意思?是设计引物特殊情况?
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板凳
发表于 2011-12-17 15:38 |显示全部帖子
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回复 cellbuddies 的帖子1 Z+ H5 U+ p9 u: c* h$ Z

( L& L7 {# T: \2 g  W刚才查到了,订购了。非常感谢你的帮助。: j( U! h) D$ K1 ^& x7 Y* \
$ [- a' {4 X1 k. D! \+ g  ?. m8 N) N0 _

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报纸
发表于 2011-12-17 15:40 |显示全部帖子
回复 jennyshy 的帖子
/ o: i  x$ E' b) `$ {
5 ~; }. H3 w; p0 u+ L, l3 Z9 w再请教一个问题,用GC rich条件会减少杂条带吗?
0 w+ y- r8 ~1 u( R* p& ^6 {/ p/ B9 C' d9 U% m2 m" C
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