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[请教] PCR中,延长退火时间和增加退火的循环次数有什么区别吗? [复制链接]

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楼主
发表于 2012-5-30 22:36 |显示全部帖子
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退火时间延长是没有意义的。一般而言30s的时间充分且必要。循环数在特定前提之下确实可以提高产量,但看你说的这种情况,不像是能提高循环数就能做出来的。
" g& S# {( u5 W: t几个关键信息,如果你不告诉大家,大家无法帮你分析:
  R% t: j1 t  v$ p5 k% P2 w6 n1,模板是cDNA吗?还是基因组?还是细胞或组织?7 E( c- P3 w# ]* {" t
2,模板的GC含量如何?
( |/ L- w: A9 H" G3 s5 k3,你用的是什么公司的什么酶?至少要告诉我是普通的Taq还是KOD之类的高保真酶?
* Z  m2 R( v9 V4,你现在的反应条件。你现在PCR圈是数是多少?延伸反应时间是多少?
2 p5 K  L% W8 A5,你最好把你的2000多bp的序列贴出来,(不仅要包括目的序列本身,还要告诉我们目的序列之前和之后各100以上bp的序列),再把你的引物序列贴出来,大家可以帮你看看引物是不是有问题。你设计引物时设计的Tm值是多少度?' v5 D2 `( ~- m$ |7 H
6,你所谓P不出来,是完全没有任何条带吗?还是没有P出来目的条带,但是有其它大小的条带?还是是一个拖带的形状?你最好把胶图贴出来,便于大家分析。你确定不是PCR体系本身的原因吗?有带一个阳性对照吗(就是你实验室其他的人曾经P出来的序列,你使用他们的引物和模板,确实能够P出来他们所P出来的序列,但是同时做的实验里面你自己的PCR没有P出来)?
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