ips检测外源性和内源性OCT4的引物设计

cbjonathan

YAMANAKA文中提到的外源性检测的序列
/ E! \& z' X1 j! }5 H
( ~) K4 I0 ~1 r, UhOCT3/4TG -S944         CCC CAG GGC CCC ATT TTG GTA CC * A! T! I3 A$ d0 Q
hSOX2TG-S691                 GGC ACC CCT GGC ATG GCT CTT GGC TC
4 u8 X- a% e2 j3 E, ~hKLF4TG-S1128                ACG ATC GTG GCC CCG GAA AAG GAC C 1 h1 ^7 e" L+ R+ q  S
hMYCTG-S1011                CAA CAA CCG AAA ATG CAC CAG CCC CAG 3 ~1 L/ g& v. |) k+ n/ [
具有共同的下游引物 PMXsTG-AS3200        TTA TCG TCG ACC ACT GTG CTG CTG
% U) o0 x3 g( }' b! p" `0 i9 c7 l' s
我想问的是在什么位置设置内源性和外源性引物可以区分内源性和外源性的OCT4的表达水平？
- t( V6 C) r1 Z5 W# {- y- z. N. d我的理解是： 两段LTR及内部的OCT4基因一起被病毒介导连接到了细胞基因组上，那么只需要将引物设计在LTR附近就可以测到外源性基因的转录水平
$ Z! U. D$ [/ @, j2 J                    但是如果两个引物都设置在OCT4内部，就无法区分外加内的OCT4表达量和纯的内源性的OCT4的量？ 是这样的吗？
$ }4 g/ ]8 m1 v. v谢谢

thinktank

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& `$ Q6 b% b/ v) i$ d$ t我也一直有这个疑问，百思不得其解，刚好你问了，等待大神解答。