染色质基因分析可识别癌症起源

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染色质基因分析可识别癌症起源
  s' i. k1 I6 _& S; p) P来源：科技日报 / 作者： / 2016-07-13* ^# Y4 q( y, f& U# i
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白血病细胞
, K& B/ a( U$ x美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法，通过对开放染色质进行全基因组分析，来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究11日发表在《自然—通讯》杂志上。4 ~1 e+ Z+ o  s4 V0 F8 p% E$ k
每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞，研究人员就可以分析出癌症的亚型，进而开发出新的诊疗手段，但现有方法很难从大量肿瘤细胞样本中识别出其起源细胞。
; v  x6 ^0 `) E7 A' E; M4 r4 `* q6 p染色质是细胞核内的重要成分，由DNA、组蛋白、RNA组成，在细胞进行分裂的特定阶段会聚缩成染色体。每种类型的细胞都有一个独特的染色质结构，封闭染色质会紧紧缠绕在核小体周围，相对不活跃；开放染色质与核小体的联系程度则相对松散，也更活跃。杰克逊实验室的助理教授珍妮弗•特罗布里奇博士通过分析肿瘤细胞中的开放染色质，改进了目前识别肿瘤细胞的起源细胞的方法。
4 q# t7 p2 A0 l3 l5 P' z特罗布里奇带领实验室同事构建了一个急性髓系白血病（AML）的小鼠模型。他们从人类和小鼠的骨髓中找出5种细胞：长期造血干细胞、短期造血干细胞、多能祖细胞、普通髓系祖细胞以及粒细胞巨噬细胞祖细胞。这些不同起源细胞引发的AML在小鼠身上显示出不同的侵入性:干细胞引发的病变更具侵入性，而祖细胞引发的病变的侵入性则要小很多。不同侵入性诱发白血病细胞出现的频率也有所不同:干细胞高，祖细胞低。
2 k4 ]6 p4 ?( j2 O3 t研究人员通过对不同AML细胞样本的开放染色质进行分析，并与正常细胞中开放染色质模式进行对比，进而确定了AML细胞样本中开放染色质的特征和基因表达模式，这使他们能将干细胞引发的AML与祖细胞引发的AML区别开来。4 m) M% s# X4 r
研究人员表示，通过对健康人群和AML患者群的干细胞和祖细胞的开放染色质进行进一步研究，他们就可以基于细胞起源来确定更精确的癌症生物标志，这对于癌症的诊断和治疗具有重要意义。
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