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真核细胞RNA 提取及RT-PCR. a# y8 M* D4 L' \$ s
第一部分:RNA 提取(以六孔板为例)
# M1 K0 e- ]' N# s( c1、 收细胞:将转染或因子处理后的细胞用胰酶消化后,PBS洗三遍,弃上清。
& o, L! C% x: _* M+ W& W) r. u2、 裂解:每管样品中加1mL Trizol,室稳放置15-20分钟至液体澄清。
, ~9 f$ z g7 S/ V3 y; n: V3、 萃取:每管加0.2 mL 氯仿,震荡混匀(使用震荡器震荡,直至样品呈现粉白色浑浊均匀的液体),室温放置2-3分钟。(可见分层,上层为白色下层为粉红色)4℃,12000rpm,10min., g/ L% }# Z; G- Y0 |6 M$ ^+ V
4、 取离心后的上清置于另一RNA专用EP管(不要取到分层处)。
; j1 X/ h: j; W0 ]' D6 \8 w5、 抽提:在以上体系中加入等体积的异丙醇,颠倒混匀后,室温放置10分钟。4℃,12000rpm,10min,去上清,沉淀为白色片状产物。- ?- L) Y& e+ \. v
6、 漂洗:每管用0.5mL75%乙醇(DEPC水配成)洗两遍,每次4℃,12000rpm,5min.最后一次空离3-5min,彻底去除乙醇。细胞台中风干1h.
* E. b* g* t" m/ M5 v) D2 w, D7、 洗脱:每管用25-30 uLDEPC水重悬RNA,立即用于cDNA合成或-70℃保存。' \+ ]8 a& m e; w
+ h6 W+ O% B$ j8 i6 O- @; [8 Y' T9 Y% S% I6 x- T2 o
第二部分:RT-PCR7 F5 H; b, P2 ~: a9 H$ m: v
1、分光光度仪测RNA浓度和纯度, 取4ugRNA+2uL oligo(dT)+DEPC水(补至总体积17uL),70℃水浴5min,立即冰浴,冷却。
# Q5 S, X {0 t/ R: U8 ]2、在上述RNA+oligo体系中加入:. H8 z: S% G8 e) f+ V% v& Z( l P
5× Reaction buffer 5uL
( Y; Q! A: S8 r 10mMdNTP 1.5uL
7 ? S: f. @' O$ N: u2 [rRNasin 0.75uL
1 v: i& p5 N& x- o. g0 ~4 W' d8 ZM-MLVRT 1.2uL
0 X1 c; F j0 e! S) k6 X终体系为25uL,42℃,60min得到反转录产物,可立即用于PCR或-20℃保存。
" S# J7 {/ P c注意事项:整个实验过程中严格按照RNA相关操作规程,勤更换PE手套,配戴口罩、帽子,使用RNA专用枪尖和试剂,全程尽量少说话,防止RNA酶污染。 |
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