有关预测、分析CpG岛的软件

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1、预测CPG岛的在线软件
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2、CpG岛序列分析软件。此类软件根据一定的规则对基因组DNA序列的CpG岛进行预测。CpG岛的准确预测是进行MSP和BS引物设计的基础。不过，在第一类软件中往往也包括了CpG岛的分析与预测功能。, _- W; s& e2 l. p/ y
软件：CpGPlot/CpGReport/Isochore
  q/ d4 E& G  b/ _" s. f& g8 l主页：http://www.ebi.ac.uk/emboss/cpgplot/
: U8 t- I# b( ?4 h" N( g8 w简介：由欧洲EBI网站提供的基因组DNA序列CpG岛分析软件，单凭EBI的名气，想必大家对其功能平添几分信任度吧？
% ^3 L) c: q& {3 }4 i) D+ B+ x& o文献：暂缺) P& W0 \! }1 `8 U. a# F' d
推荐：★★★★★
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* L, x( ~. g1 ?( m3 B2 k1 c软件：CpGProD
+ P5 R. H5 e, r! g主页：http://pbil.univ-lyon1.fr/software/cpgprod_query.html
% z8 c" |6 n, K% r简介：CpGProD也是一款专门针对哺乳动物基因组DNA序列CpG岛进行分析的在线软件，其特点和功能类似于上述介绍的EBI网站的相关软件。
; X8 J1 L* K! o+ [6 _8 G文献：暂缺
. V3 v3 b1 @8 |! v" r# S* X1 m" {推荐：★★★★☆
: u7 O# b  E$ R# F2 y1 `! D( ?3 K& f# c
软件：CpG Island Searcher
! f$ z5 w! w0 A. h- D主页：http://www.cpgislands.com/；http://cpgislands.usc.edu/1 f( O# c9 M8 I/ ^
简介：基因组DNA序列CpG岛进行分析的在线软件，其特点和功能类似于上述介绍的EBI网站的相关软件。8 b% j9 O- i8 p0 @! l. \
文献：Takai D, Jones PA. The CpG island searcher: a new WWW resource. In Silico Biol. 2003;3(3):235-40 (PMID: 12954087)
% B0 X9 q0 {* y- g# J8 V  n7 i推荐：★★★★☆
6 R- |8 t2 Z) X+ ]
1 l. Q8 K7 c' }& G7 e软件：CpG Prediction ：http://www.ualberta.ca/~stothard/jaascript/cpg_islands.html# h+ w: {- W, @1 r5 W
9 A2 j3 z. }+ e, J2 {
软件：CPG island 2：http://inn.weizmann.ac.il/EMBOSS/，工具很多，cpg岛工具cpgplot肯定有，自己慢慢找

ghfmaster

请教老师：分析序列后获得的三个图片如何分析？怎样得知是否有CpG岛？

ghfmaster

是欧洲EBI网站提供的基因组DNA序列CpG岛分析软件分析获得的图片