经历重编程的细胞逆分化之路有没有终点？

sunsong7

6 g  j, [  f) _- D# t. H

, k* L4 L( D2 y! m/ @2 [3 n回复 xiangchou812 的帖子8 p) k8 r; A# i# L' r
3 W8 b0 C$ `; L1 y/ a
还是Yamanaka够黑够厚够狠，当着天下人面指鹿为马，硬是把转基因说成重编程，把人造致瘤性细胞说成是胚胎干细胞；把胚性微环境重编程说成是iPS具有全能性...

w343989328

以下皆是本人的YY结果，如有不妥请不吝赐教。
8 I* N" m, m  `1 T+ e+ _第一，认为IPS涉及到的还是表观遗传层面的，虽然山中伸弥使用逆转录病毒导入四个“外源性基因”，但成纤维细胞遗传物质里也存在对应的四个基因，只不过被沉默了。后来美国的研究者使用miRNA，绕开逆转录途径也诱导出IPS。我认为，除了非编码小RNA途径，现在人类还无法通过改变特定基因的甲基化/去甲基化等等方式改变表观遗传修饰，从而控制基因的启闭，所以只能用山中伸弥这种很僵硬的方式进行重编码。如果有一天，人类能通过信号传导的路径，或者是加入诸如从头甲基化酶一类蛋白质诱导出IPS，那才是IPS的成功。2 \4 l/ ]: Y& @% Y
第二，正常干细胞在体内的发育谱系是非常精确的，肿瘤干细胞则相反，分化紊乱。肿瘤干细胞还是有部分程度向预定的正常方向分化的，然而其演进过程便是其随机分化积累的过程，包括少部分逆向分化，因此肿瘤组织具有异质性。目前恶性肿瘤细胞的行为，都存在于其他细胞中，即肿瘤干细胞不能“自创行为”，比如侵袭、迁移、自主血管是模仿滋养层细胞、神经/造血干细胞、成纤维细胞等的行为。同一种肿瘤从发生到迁移侵袭的过程时间大部分有规律可循，而不同肿瘤恶变的时间大不一样，这可能是由于干细胞在细胞谱系上与能发生对应行为的细胞关系远近的缘故。
& l) m3 J, W* k/ d第三，按照楼上的说法，重编程的终点将是单细胞生物。我觉得有一定可取。在体外培养的话，细胞只需要维持细胞独立生存这一部分基因表达就行了，这在哺乳动物的基因组中只占少数。而其他的基因，突变可能积累，最终导致核型异常，基因缺失，甚至演化出新物种也有可能。这是进化论的观点了。

w343989328

回复 sunsong7 的帖子
: E6 u  ]) d6 D  O, S
/ A6 h, l; ?4 d2 h老狼的说法未免太过了吧。。。胚胎干细胞难道不是一种致瘤性细胞吗？胚性微环境能重编程？那么还要辛辛苦苦去克隆多莉羊干嘛？

sunsong7

回复 w343989328 的帖子
# s6 o5 l' k+ N7 a* m5 U) ]. [9 H, U3 y6 R/ p1 Q$ _
胚性微环境下全能干细胞及肿瘤倾向于有序分化，参见“重编程技术革命——niche reprogramming http://www.stemcell8.cn/thread-40755-1-1.html ”

w343989328

回复 sunsong7 的帖子, [1 p& l& _+ a
$ Y$ _, w5 Q& @' M, g- U- R
胚性微环境是诱导分化吧。。而重编程应该是逆分化的呀。。

sunsong7

* J* n  q2 p. n4 G0 D6 \! L9 A5 k9 {
回复 w343989328 的帖子2 f1 N0 a& t0 j, r5 J2 _- |

5 x, h& Z! A4 H  G" @" V囊胚一类的胚性微环境（embryonic microenvironment）比较特殊，可以对细胞进行表观遗传重塑（remodeling ）或归零（reset），包括DNA甲基化/去甲基化、组蛋白乙酰化/去乙酰化等，属于细胞重编程(reprogramming)的范畴；正是因为iPS细胞没有经历过胚性微环境“归零”过程保留了一些起始细胞的表观遗传特征才备受诟病...
- X/ ~, d: }" g1 \' |
6 N/ }; c4 X; w2 E0 ^

张也行

回复 sunsong7 的帖子& g  x$ Q! M& J) t

: O+ P( L2 d% b9 @+ S3 b同意你说niche对细胞的特性有重要的作用。但是首先细胞要是多能性的细胞才能形成嵌合体吧？体细胞放到囊胚总能形成嵌合体吗？EpiSC有一定的多能性，但是EpiSC却不能嵌合体。- L/ b% W! ^, ]8 G+ `2 t
6 h! F8 W  S1 S) w) i9 l
不知道老狼是否还有其他的方法证明多能性。

sunsong7

回复 张也行 的帖子& z' e4 Q5 K1 X! p' v! s# D/ Q
, |+ j7 z' G/ Y/ p. J4 M3 e, E
参见：重编程技术革命——niche reprogramming http://www.stemcell8.cn/thread-40755-1-1.html1 S, R4 P* e! e

张也行

回复 sunsong7 的帖子# @5 O0 @9 A6 Z  o4 ]
- @1 U; D6 R3 _4 Z& J
See, that is where you lost me. You take the cytoplasma of cells as the niche of the cell, too. Is this right?7 x& [- ]2 t  |' R+ \

% U1 `# \, O+ |0 A! ]- m/ |Besides, how is "niche reprogramming" possible in vitro? I mean how can the stem cell niche even be constructed in vitro? The in vivo niche are established by several kinds of cells working together.9 D% N  F2 S  C; @! K. b

sunsong7

niche reprogramming refer to the interaction of niche  and cytoplasma，it is not meam cytoplasma is the part of  cell niche ...9 g6 j9 Z  w( O+ D$ I

& p$ S0 P0 ^( f+ h- l2 m( t8 ]I believe that "niche reprogramming" is possible  in vitro，  here I would like to introduce the conception “artificial niches ”  ... http://www.stemcell8.cn/forum-re ... 290-pid-368194.html6 [7 D( T7 p/ Y* U* f+ V

: }4 T" F' G2 r* N, `. J. R8 h' K