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慢病毒转导mES之promoter选择   [复制链接]

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楼主
发表于 2011-7-6 17:04 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
干细胞之家微信公众号
最近用慢病毒向mES中转一个基因,病毒是经过50000g离心浓缩,TU值足够高,感染293T和MEF是没问题的,但表达GFP的mES克隆基本上没有。请高人给分析一下原因!另外,GFP的promoter是CMV, 这个是不是在mES当中表达很低啊,CMV \EF1-a\PGK\CAG\MSCV这些启动子在mES中哪个是最适合用的啊?
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沙发
发表于 2011-7-6 17:57 |只看该作者
本人开始也是使用含CMV启动子的载体,但在ES中转染效率非常低,于是使用由3中启动子合成的CAG,发现质粒的转染效率提高至少10倍以上。使用慢病毒载体,我使用过CMV \EF1-a\PGK三种启动子,CMV最差,EF1-a最好,PGK次之。根据我的经验,建议使用含EF1-a的慢病毒载体,我记得Invitrogen有售。含CAG的慢病毒肯定也会工作,但我没试过。另外做ES转染。不要用GFP,可使用Venus荧光蛋白,比GFP亮10倍,也是绿色。使用CMV启动子做其它干细胞转染,效果相对也较差。
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藤椅
发表于 2011-7-6 21:48 |只看该作者
回复 christophe 的帖子
$ t- Q" }8 d3 M9 Y9 |: c) Y7 a% K8 B
) X* W5 |( s' l0 J% o, |) @; t  Y" m: K
     to christophe战友:* K: f/ M8 M8 D" g& p# A/ U- i
2 ]4 n+ V9 C1 B! N' K
     mES中确实存CMV启动子的转基因沉默问题。
! o9 X8 A- }& m3 J( B& d, W. W8 H
     广 州 赛 业 前一段的培训中也提到过这个问题。) |, G( ^$ n. Y/ `

4 Y  P* {+ ?* z: z3 S     我们实验室Reading Report时我还讲过相关的一篇文献,我给你找找看,如果能找到我会上传到下面。
+ P9 |, \: J6 z: p' G
4 g" |$ X7 H* s0 n' W     解决这个问题的方法是换用CAG或者EF1a启动子。
2 V4 f8 U: b- }! |( o$ j5 G$ b+ x) H( w' Y2 Z
. Y& M$ B5 Z1 k# K, Z, E     以上只是我对这个问题的一些初步了解,如果有问题欢迎继续交流。
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板凳
发表于 2011-7-7 15:29 |只看该作者
回复 username 的帖子  O& p) O# u1 E

2 _$ y3 x' W3 c) f5 o谢谢你的宝贵经验!看来我需要换一下其他的启动子了。再麻烦问你一下,你做慢病毒转导mES效率能有多高啊,有什么关键步骤需要特别注意的吗?做慢病毒感染mES快两个月了一直不是很成功。
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报纸
发表于 2011-7-7 15:46 |只看该作者
回复 深海寂寞鱼 的帖子1 q% S' }8 a. |! O5 I8 Y  x
" _% y0 J; H0 n, B) p  P4 d
谢谢!那你了解CAG OR EF1a 比CMV在mES中的基因表达效率能高多少倍呢?我也找到一些这方面的相关资料,贴上来一起探讨一下。
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地板
发表于 2011-7-7 15:50 |只看该作者
在第二个资料是关于lentivirus转导hES的,在Page127 有一段话:When applying lentiviral vector-mediated transgenesis in hESCs, the most  critical  issue  to be  considered  is  the  selection of  a promoter. Another  critical  issue  is  the  selection method  for obtaining  a  pure  population  of  transfected  cells.

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7楼
发表于 2011-7-7 20:22 |只看该作者
回复 christophe 的帖子' n! N& i- S2 N. q( h5 u
) {) y, t1 b# K. W+ B4 `) l
我做通常转染效率在60%左右(60%细胞表达GFP)。几点注意:1.我使用293FT包装细胞,而不是293T细胞,包装效率会增加一些,这细胞Invitrogen有卖;使用生长较好的293FT细胞包装。2.我使用Invitrogen出售的包装质粒,含三种质粒的混合。2.使用新鲜制备的病毒感染,mES也同时保持良好状态。3.使用悬浮细胞感染,总体积在1ml左右,感染3小时左右,每30分钟摇晃含细胞的离心管一次。我相信你的细胞感染效率低是启动子问题,换CMV后会改善。
3 a* A& x; B* k& b+ ^( q, m1 M. x' m' T- `1 |

  ^* R. m+ l% O' k3 O+ K, j* C/ m2 x: n* X
& B1 Q* O7 Q4 o- ^& Y1 X* x9 {# k
  4 ]: a+ o6 b% T$ S) v
3 Y* c" f$ f& L! c* c! M" }

; m1 L( l* a* F( k. [5 f' p 参与/回复主题 关闭
1 p6 O' C( W) h! R1 h+ e! s, Q
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8楼
发表于 2011-7-7 23:28 |只看该作者
回复 username 的帖子- P$ B. d( ^* G; ^
% w. ], i2 y4 I& `% f, L( N5 e
谢谢你的建议,你的效率真是挺高的啊!
# Y& S* t% `3 u# G我换一个启动子试一下,有了结果再交流!

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9楼
发表于 2011-9-2 11:21 |只看该作者
实验正好遇到此问题,总算找到组织了,呵呵。+ ~4 d" D; b7 e3 G0 G2 ^1 x
我想了解一下,是不是说在诱导过程中所用的SKOM四因子不用CMV promoter的vector?  @0 v* P" G; y1 m. h/ A4 l( _; B
看了上面的文献,假如我用CMV promoter的vector转染诱导成功的iPS,目的基因也会表达不强,是这个意思吗?
. [7 Z; g$ v6 l4 k& v但是实验室资源有限,现在手头有的就是CMV的,那该怎么办啊?自己重新构建?
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10楼
发表于 2011-9-2 11:26 |只看该作者
回复 Elaine韩 的帖子' E: }7 C+ X4 z; A& e
% p5 z0 }, }8 n
制备iPS使用的是成纤维细胞等成体细胞,因此CMV是可以的,而转染ESC等干细胞时需注意启动子的问题。
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