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慢病毒转导mES之promoter选择   [复制链接]

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楼主
发表于 2011-7-6 17:04 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
最近用慢病毒向mES中转一个基因,病毒是经过50000g离心浓缩,TU值足够高,感染293T和MEF是没问题的,但表达GFP的mES克隆基本上没有。请高人给分析一下原因!另外,GFP的promoter是CMV, 这个是不是在mES当中表达很低啊,CMV \EF1-a\PGK\CAG\MSCV这些启动子在mES中哪个是最适合用的啊?
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沙发
发表于 2011-7-6 17:57 |只看该作者
本人开始也是使用含CMV启动子的载体,但在ES中转染效率非常低,于是使用由3中启动子合成的CAG,发现质粒的转染效率提高至少10倍以上。使用慢病毒载体,我使用过CMV \EF1-a\PGK三种启动子,CMV最差,EF1-a最好,PGK次之。根据我的经验,建议使用含EF1-a的慢病毒载体,我记得Invitrogen有售。含CAG的慢病毒肯定也会工作,但我没试过。另外做ES转染。不要用GFP,可使用Venus荧光蛋白,比GFP亮10倍,也是绿色。使用CMV启动子做其它干细胞转染,效果相对也较差。
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藤椅
发表于 2011-7-6 21:48 |只看该作者
回复 christophe 的帖子# V4 Q5 P2 ^" M; c1 k/ @
0 u/ c. O" Z- I- @8 f" u6 Z

9 I& P9 [8 |- j     to christophe战友:
% r  k: \/ ]" ^7 L' l" J
1 Y0 I: F7 _& P% T7 t     mES中确实存CMV启动子的转基因沉默问题。/ U# O: f4 Z3 d: \0 t9 z6 _
% `' m1 O8 T% J( Q  b9 ^
     广 州 赛 业 前一段的培训中也提到过这个问题。
& A0 l* w" }6 o; z, a
  o7 Y' [9 e  f8 w& `3 J0 z, L     我们实验室Reading Report时我还讲过相关的一篇文献,我给你找找看,如果能找到我会上传到下面。
; P8 W9 O& M( M$ v4 z( H
& |8 y4 _* O9 G4 @     解决这个问题的方法是换用CAG或者EF1a启动子。7 k- [9 i" b  t" A1 {* h

! l; d& {' D8 R* d( c- D# u     以上只是我对这个问题的一些初步了解,如果有问题欢迎继续交流。
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板凳
发表于 2011-7-7 15:29 |只看该作者
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回复 username 的帖子
5 [- i* U! V0 `* U
) f# \1 L# [. A- O% _谢谢你的宝贵经验!看来我需要换一下其他的启动子了。再麻烦问你一下,你做慢病毒转导mES效率能有多高啊,有什么关键步骤需要特别注意的吗?做慢病毒感染mES快两个月了一直不是很成功。
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报纸
发表于 2011-7-7 15:46 |只看该作者
回复 深海寂寞鱼 的帖子
. @- [5 S( k( e6 J5 f
! A' r4 g* k( |. d; S谢谢!那你了解CAG OR EF1a 比CMV在mES中的基因表达效率能高多少倍呢?我也找到一些这方面的相关资料,贴上来一起探讨一下。
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地板
发表于 2011-7-7 15:50 |只看该作者
在第二个资料是关于lentivirus转导hES的,在Page127 有一段话:When applying lentiviral vector-mediated transgenesis in hESCs, the most  critical  issue  to be  considered  is  the  selection of  a promoter. Another  critical  issue  is  the  selection method  for obtaining  a  pure  population  of  transfected  cells.

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发表于 2011-7-7 20:22 |只看该作者
回复 christophe 的帖子% z" p0 q0 h* i) `! V
$ M( Y( K" y3 M8 D
我做通常转染效率在60%左右(60%细胞表达GFP)。几点注意:1.我使用293FT包装细胞,而不是293T细胞,包装效率会增加一些,这细胞Invitrogen有卖;使用生长较好的293FT细胞包装。2.我使用Invitrogen出售的包装质粒,含三种质粒的混合。2.使用新鲜制备的病毒感染,mES也同时保持良好状态。3.使用悬浮细胞感染,总体积在1ml左右,感染3小时左右,每30分钟摇晃含细胞的离心管一次。我相信你的细胞感染效率低是启动子问题,换CMV后会改善。
4 X8 a/ {- ?5 j- w
; ^, H3 L, a# D8 c) b# |3 R; o! k4 i+ D+ o# x# ]1 B  E6 d5 G$ O

. A& l7 F# Q" b
7 C4 F3 O0 |2 j. f, H  
4 ?- C# a# Y) q- _. F( F8 s6 A$ b1 i$ Z5 i- s, x4 D; [( _" s( y, @
2 |9 L. ]! g- A, `
参与/回复主题 关闭 9 Z' _- {! o; y( r
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发表于 2011-7-7 23:28 |只看该作者
回复 username 的帖子0 L/ S: H& [. v

! p, U7 H, b3 n* g' @& |, W谢谢你的建议,你的效率真是挺高的啊!
9 d% x! p: v4 n% i  @" q3 I我换一个启动子试一下,有了结果再交流!

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发表于 2011-9-2 11:21 |只看该作者
实验正好遇到此问题,总算找到组织了,呵呵。8 o( m" e. @0 @, m9 O: Z
我想了解一下,是不是说在诱导过程中所用的SKOM四因子不用CMV promoter的vector?4 \3 N) C& `6 |' {) N( p3 u# P, _
看了上面的文献,假如我用CMV promoter的vector转染诱导成功的iPS,目的基因也会表达不强,是这个意思吗?
  m5 w7 E) F2 M+ {! W# t但是实验室资源有限,现在手头有的就是CMV的,那该怎么办啊?自己重新构建?
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发表于 2011-9-2 11:26 |只看该作者
回复 Elaine韩 的帖子
2 m6 b/ Y- f7 h
: [3 P2 R( ?3 K8 g8 O) H制备iPS使用的是成纤维细胞等成体细胞,因此CMV是可以的,而转染ESC等干细胞时需注意启动子的问题。
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