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慢病毒转导mES之promoter选择   [复制链接]

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楼主
发表于 2011-7-6 17:04 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
最近用慢病毒向mES中转一个基因,病毒是经过50000g离心浓缩,TU值足够高,感染293T和MEF是没问题的,但表达GFP的mES克隆基本上没有。请高人给分析一下原因!另外,GFP的promoter是CMV, 这个是不是在mES当中表达很低啊,CMV \EF1-a\PGK\CAG\MSCV这些启动子在mES中哪个是最适合用的啊?
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沙发
发表于 2011-7-6 17:57 |只看该作者
本人开始也是使用含CMV启动子的载体,但在ES中转染效率非常低,于是使用由3中启动子合成的CAG,发现质粒的转染效率提高至少10倍以上。使用慢病毒载体,我使用过CMV \EF1-a\PGK三种启动子,CMV最差,EF1-a最好,PGK次之。根据我的经验,建议使用含EF1-a的慢病毒载体,我记得Invitrogen有售。含CAG的慢病毒肯定也会工作,但我没试过。另外做ES转染。不要用GFP,可使用Venus荧光蛋白,比GFP亮10倍,也是绿色。使用CMV启动子做其它干细胞转染,效果相对也较差。
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藤椅
发表于 2011-7-6 21:48 |只看该作者
回复 christophe 的帖子/ H9 h- H6 z6 S. Q4 G! k. i$ u

+ E2 I! N9 ]- q& T, ?0 k" A2 n; g) v- [( k# v- L- N8 G) ]& s
     to christophe战友:! y  |. r* h& a4 E  [0 f

8 N1 O! ?' u" N" |. m     mES中确实存CMV启动子的转基因沉默问题。
1 y9 K: l9 ]1 v6 r" b3 z
! V7 T7 H5 j4 X0 ]3 [     广 州 赛 业 前一段的培训中也提到过这个问题。
6 D# t1 K  X$ C, \9 u1 f* t" R% ]# P9 @7 o" ~
     我们实验室Reading Report时我还讲过相关的一篇文献,我给你找找看,如果能找到我会上传到下面。0 }6 d$ g- W8 v7 c! L

8 t' q; E5 P# I# H8 _2 L( o     解决这个问题的方法是换用CAG或者EF1a启动子。9 C& \7 |* l" V) E5 N+ N; v

2 j" ?3 G5 o; {, S     以上只是我对这个问题的一些初步了解,如果有问题欢迎继续交流。
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板凳
发表于 2011-7-7 15:29 |只看该作者
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回复 username 的帖子
2 {( n# E) X' t, b& q
% @  i  t! ?: p5 y2 n& [* Q3 g( J谢谢你的宝贵经验!看来我需要换一下其他的启动子了。再麻烦问你一下,你做慢病毒转导mES效率能有多高啊,有什么关键步骤需要特别注意的吗?做慢病毒感染mES快两个月了一直不是很成功。
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报纸
发表于 2011-7-7 15:46 |只看该作者
回复 深海寂寞鱼 的帖子
. |2 q3 U8 o. @9 h2 F  W5 p- r
- t' d2 R) U- |. o% N* U- e- @, m谢谢!那你了解CAG OR EF1a 比CMV在mES中的基因表达效率能高多少倍呢?我也找到一些这方面的相关资料,贴上来一起探讨一下。
附件: 你需要登录才可以下载或查看附件。没有帐号?注册
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地板
发表于 2011-7-7 15:50 |只看该作者
在第二个资料是关于lentivirus转导hES的,在Page127 有一段话:When applying lentiviral vector-mediated transgenesis in hESCs, the most  critical  issue  to be  considered  is  the  selection of  a promoter. Another  critical  issue  is  the  selection method  for obtaining  a  pure  population  of  transfected  cells.

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发表于 2011-7-7 20:22 |只看该作者
回复 christophe 的帖子# ]  i$ D, L! L0 e
3 W- ^1 F9 l3 ?  L* d
我做通常转染效率在60%左右(60%细胞表达GFP)。几点注意:1.我使用293FT包装细胞,而不是293T细胞,包装效率会增加一些,这细胞Invitrogen有卖;使用生长较好的293FT细胞包装。2.我使用Invitrogen出售的包装质粒,含三种质粒的混合。2.使用新鲜制备的病毒感染,mES也同时保持良好状态。3.使用悬浮细胞感染,总体积在1ml左右,感染3小时左右,每30分钟摇晃含细胞的离心管一次。我相信你的细胞感染效率低是启动子问题,换CMV后会改善。: ?3 b1 k- s( H1 u$ {# e1 x7 f! w

0 V, V  s: Q; k8 L: |2 k& K. B3 [8 _' e! J1 h
8 O1 G6 {& ~, G0 p% h

$ `+ V- ~2 f/ L. n  
9 z- z7 a+ [" d' b. r
: l) S4 U. O/ [1 N- r* j
. k, F2 u7 t: D3 [: a/ _% x1 E8 j 参与/回复主题 关闭 $ p6 A1 j' `9 G% R4 i$ A1 o
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发表于 2011-7-7 23:28 |只看该作者
回复 username 的帖子
( x! T0 |' ^6 ~9 l4 s
: F3 F& l  ^2 ?+ \9 _  P谢谢你的建议,你的效率真是挺高的啊!
* k# e# V' C3 p" J% u我换一个启动子试一下,有了结果再交流!

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9
发表于 2011-9-2 11:21 |只看该作者
实验正好遇到此问题,总算找到组织了,呵呵。; ]# u" x. j- l4 R
我想了解一下,是不是说在诱导过程中所用的SKOM四因子不用CMV promoter的vector?
9 {  ]. J8 _$ K3 t# d& l' {看了上面的文献,假如我用CMV promoter的vector转染诱导成功的iPS,目的基因也会表达不强,是这个意思吗?; G; o$ ^3 s$ ?* I  p/ [3 d, w
但是实验室资源有限,现在手头有的就是CMV的,那该怎么办啊?自己重新构建?
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发表于 2011-9-2 11:26 |只看该作者
回复 Elaine韩 的帖子- |% O$ H; C) c0 j
" M  ~$ Q8 A; _' I; T0 r& f9 I
制备iPS使用的是成纤维细胞等成体细胞,因此CMV是可以的,而转染ESC等干细胞时需注意启动子的问题。
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