全基因组鸟枪法测序的主要步骤是：第一，建立高度随机、插入片段大小为1.6kb到4kb左右的基因组文库。克隆数要达到一定数量，即经过两端测序的克隆片段的碱基总数应达到基因组大小的6到10倍。第二，高效、大规模的克隆双向测序。第三，序列组装。借助Phred, Phrap, Consed 软件进行序列组装，产生一定数量的contig。第四，填补缺口。有两种待填补的缺口，一是没有相应模板DNA的物理缺口，我们通过PCR的方法进行填补；二是有模板DNA但未测到的序列缺口，我们直接在模板DNA上设计引物测序。9 u. ^6 [- O3 o
发表于 2011-12-2 18:33
