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求一篇正儿八经的专门讲如何用lentivirus转染ES或者SSC的文献 [复制链接]

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金话筒 优秀会员

楼主
发表于 2012-2-28 11:40 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
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整个板块号称是研究如何转染ES,但看起来全都是讲如何包装病毒、如何做感受态之类的很基本的东西。有哪位达人手上有专门讲如何转染干细胞特别是ES或者SSC的文章?希望能包括如下一些内容:/ v( A& ~0 `# q: ?3 u' n
1,需要的病毒滴度;! f1 `9 j) x' Y4 I. K
2,ES(或SSC)的转染的目的基因(或RNA)promoter的选取的特殊性,和各个promoter的强弱关系(CMV,EF1a,CAG,H1,U6等)和它们的适用情况;; T! D$ l6 y  @9 k# X
3,与基因表达后被细胞沉默相关的知识,比如说CMV转到ES之后会沉默但细胞分化后会重新开启吗?. P. J, q( f2 |5 W$ G" d
4,用何种protocol转染,具体程序,包括如何铺细胞,加不加MEF做feeder,加不加polybrane,转染几个小时,转后何时换液,最后何时检测阳性细胞,第一次转染一种ES的时候各种条件怎么摸(哪些条件要摸个小梯度),如何用药物筛选阳性(包括如何做药物浓度的曲线);
) P+ g% Z  X9 ~1 Q5,各种trouble shooting。2 L6 g, N- t. a: [: J
期盼各位达人的指导。我是做SSC的,需要转染lentivirus。昨天在这里也看到一位网友要做这个实验。
4 W$ D! D3 O6 z( A我对做这一块非常没有经验,从文献和各个同学的反映来看,这一行的水也很深,鄙人觉得亚历山大~
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金话筒 优秀会员

沙发
发表于 2012-2-28 12:54 |只看该作者
这个问题太大了,没看到有这么全的文章,你从公司买的话,倒可以仔细问问。0 Q9 V% D0 V* N
1:需要的滴度和细胞类型有关,一般给出的有效滴度都是以包装细胞如293T之类为靶细胞感染测量的,不同的靶细胞需要先测试下感染效率。以90%以上的阳性率为达标。7 H6 _2 i! n$ X% |- L
2:除非有文献报道说某个启动子不能使用,一般CMV,EF1a之类都是常用的。可以通过报道基因来看一下效率。
, H5 B! j1 ]7 |2 \3 G, b3:不清楚,CMV被沉默好像也不是百分百的,只是表达量稍低吧?
, [2 W2 H) B* K1 b. o' u2 N4:病毒进入靶细胞,不能叫转染了,应该叫感染。转染是前期包装病毒时的操作。至于feeder cell,最好在无饲养细胞的时候操作。polybrene是用来增加感染能力的,有一定细胞毒性,需要试试浓度,不加就能感染的话,就不要加了。药物筛选和普通细胞一样。# T' h+ o1 g# Z( R3 H
! R  E- P) A# _8 p, `
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藤椅
发表于 2012-2-29 01:57 |只看该作者
同求 帮顶

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金话筒 优秀会员

板凳
发表于 2012-2-29 10:54 |只看该作者
ES中会感染病毒的,至于CMV沉默也有人提过,这方面的文献还没看到。。。
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报纸
发表于 2012-6-9 09:28 |只看该作者
ES中不同promoter 活性文献
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地板
发表于 2012-6-9 10:03 |只看该作者
前几天刚慢病毒做了个干扰,CMV驱动荧光,荧光有强有弱,选强的就行了,荧光看起来也挺好。
* {7 ^. c2 Z* E2 P) _5 n; P) Y( ]1,需要的病毒滴度;7 E% B7 d1 |  K% n; e) f
---------------直接病毒液转,不测滴度
7 E! ~+ {$ J# }  E, q8 U, ~2.和各个promoter的强弱关系(CMV,EF1a,CAG,H1,U6等)和它们的适用情况;
* ^* q* U% I0 ~0 v" J) @& ?----------个人以为绝对的强弱可能并不明显,可能跟插入位置有关,当然有人说EF1比较强。7 [* F2 }3 w' j6 H2 B
3.与基因表达后被细胞沉默相关的知识,比如说CMV转到ES之后会沉默但细胞分化后会重新开启吗?)
6 Z. B7 b9 y- n, U; T' H0 M----------沉默为什么会影响分化呢
, \+ A% `  g9 ?) U% D8 V4,用何种protocol转染,具体程序,包括如何铺细胞,加不加MEF做feeder,加不加polybrane,转染几个小时,转后何时换液,最后何时检测阳性细胞,第一次转染一种ES的时候各种条件怎么摸(哪些条件要摸个小梯度),如何用药物筛选阳性(包括如何做药物浓度的曲线)/ ?: r1 K" b% m7 T! T& \  u& w
------------------加mef,不加polybrene,当然推荐加8 |( T6 ?  V9 Z4 `
5 各种trouble shooting。1 C$ r4 V# R3 W; V4 K1 A
------------------没什么trouble
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