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神经干细胞RT-PCR怎么选择标志物 [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2012-3-4 20:16 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
我想做神经干细胞的RTPCR,但是查不到nestin的序列,希望有这方面文献的前辈能够分享下;另外问一下这个除了选择nestin的是不是还可以选择别的标志物做,是不是做一种就可以,谢谢
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沙发
发表于 2012-3-4 21:53 |只看该作者
回复 caiwwcom 的帖子5 e0 X' m: k1 `% Y

  O8 K* r5 }( r7 [: \" L! r3 `; ]为什么查不到Nestin的序列???NCBI或者Ensembl上面都有啊,注意选择mouse或者rat的就好啊,很简单的。
% Q7 @- Q$ P# o% m# _如果鉴定NSC,Nestin肯定是要的,然后根据你研究的东西,选择其他的marker or control啊
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藤椅
发表于 2012-3-5 09:08 |只看该作者
回复 jessewill 的帖子& {/ R. r" p4 R: e" x
7 o3 l! S/ W# S, i
那请问是不是就是在文献里查,没有特殊的地方吧?
$ w: e8 J& H& T# k% z. V! ~; @1 b' }还有我做小鼠的nestin基因,查大鼠的行不行,不知道有没有差别?
% u3 p, S# R9 D, r9 R5 O$ k做反转录RT-PCR,文献很多实时定量RTPCR,不知道引物是否通用
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板凳
发表于 2012-3-5 09:09 |只看该作者
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回复 jessewill 的帖子$ e3 _$ Y5 R4 D% ?

7 z: _8 ]9 t0 R# `# c" T其他的比如SOx2、notch.cd133等
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报纸
发表于 2012-3-5 10:00 |只看该作者
回复 goodboy 的帖子9 N, V# \: }! e  d4 ]  x

, v" Y0 D" z! `7 f4 N+ s/ z顺便问一下,做神经干细胞标志物是不是随机选择三个常用的就ok了,我打算选择nestin,sox2,Musashi1
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地板
发表于 2012-3-5 10:53 |只看该作者
回复 caiwwcom 的帖子. R5 a! q# c: S' Z/ c; g4 e9 z+ z
* b: ~) Q5 m( ?
这个我就不清楚了,这方面的文章看得比较少,之前看到有人做干细胞筛选用流式的方法筛三个marker就可以了  s. w' ?' w5 Y$ w. c- C9 Q4 @. F
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发表于 2012-3-10 00:25 |只看该作者
pcr也要做三个标志物吗?
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发表于 2012-3-15 13:51 |只看该作者
神经干细胞的标志鉴定要看你研究的是运动神经,还是感觉神经,还是中枢神经。6 `2 w% [' Z6 x2 ]) O
根据神经不一样,选择的鉴定物也不一样,比如Nestin, b-tubulin, GFAP等,有专门鉴定轴突的,还有鉴定髓鞘的,神经元的,等……
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发表于 2012-3-16 11:19 |只看该作者
鉴定神经干细胞,一般用nestin和mash-1共标呀。楼主可以试一试,这些在NCBI上都可以查的到序列的。
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发表于 2012-3-16 14:26 |只看该作者
回复 leozarah 的帖子
. ?: `' k+ f2 Y1 e" E& F- ]# m. Y! v+ d" N- S: ]) q
ok 打算两个都做pcr
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