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[请教] CRISPR/cas9系统中gRNA的设计 [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2013-6-16 15:06 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
26包包
CRISPR/cas9系统中gRNA怎么设计啊! \% j6 |& ^7 k% |6 [# K4 c' Q
我找的文献说得都不具体
  L* }6 m/ m$ d+ F5 p" T" r有没有详细一点的步骤?

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沙发
发表于 2013-6-17 09:58 |只看该作者
参见addgene,说的还算详细。
" ^' Y' G% {/ F5 T& c0 y- ~; X0 X另,能惠赠 CRISPR/cas9系统质粒吗
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藤椅
发表于 2013-6-17 10:01 |只看该作者
http://www.addgene.org/CRISPR/$ W$ x7 C: M+ U. s1 {
直接给链接,貌似zhang的比较好

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包包
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板凳
发表于 2013-6-18 12:22 |只看该作者
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根据zhang的site    http://crispr.genome-engineering.org/  选就行了. ?$ R' i! a' T/ I
exon上的位置 GNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NGG  中间20个随机碱基 G+19个N 可以选作一个target  最后的NGG是PAM site
/ G2 {7 p6 V* c5 H再有根据不同的plasmid 可能长度不同 我买的zhang的plasmid 刚开始做 有问题一起讨论吧
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报纸
发表于 2013-6-18 13:26 |只看该作者
quanri1126:求惠赠质粒

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地板
发表于 2013-6-19 15:37 |只看该作者
回复 chips100 的帖子
2 r, ^' E( m% \/ i: |, ~
# _  Q3 u  W1 o& A3 N9 q我不在中国,而且从addgene 买也很便宜 运费加上质粒不到1000块钱

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发表于 2014-5-16 09:07 |只看该作者
回复 quanri1126 的帖子0 R4 q. Z, r/ _( D. R8 u$ u1 h5 |/ G

3 Z; d( ~' Z- D求详细构建之过程

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发表于 2014-6-11 14:39 |只看该作者
回复一下

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发表于 2015-7-8 21:34 |只看该作者
回复 quanri1126 的帖子
" M1 d  b( s/ m! h2 F7 [
+ o0 V& U  R$ r4 O  d我想问一下,为什么中间是19个碱基呢,如果21个会怎样

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发表于 2015-7-8 21:39 |只看该作者
回复 quanri1126 的帖子
# L1 T; P3 d7 W9 X# L
) |1 ?# U4 b: C) e8 I你好,我想请教一下,在cas9中,设计gRNA引物时,用T7启动子,为什么要求靶标序列满足GGN19GG的条件,,还有为什么中间一定要求是19个碱基,如果不是19个会怎样,,还有如果我的基因里面找不到满足这样条件的序列,那该怎么办呢,跪谢,赐教!谢谢!
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