Cell：癌症突变多半发生在X染色体上

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Cell：癌症突变多半发生在X染色体上
, X3 |& j+ j# W2 i" B# u: N2013-10-22 来源：生物360 作者：koo 2 p" e/ q& v. w% G

" M$ E3 [, [6 K4 @3 I我们知道，大多数癌症的遗传物质都会发生突变。在人的一生中，这通常发生在患者自身细胞中的“体细胞突变”，而不是从父母遗传。随着时间的推移，原有的受损细胞积累额外的突变，但这它在很大程度上仍是未知的，为什么会发生突变。# o, G' h' @! d# O: I( j
现在，来自德国癌症研究中心和海德堡大学等多机构科学家们通过四百多个癌症全基因组序列比对，揭示了一种是肿瘤发生过程中的早期事件。这一发现有助于我们理解，细胞应激加速癌变的治病过程，从而导致越来越多癌细胞突变的产生。
8 O" C1 P! r! ?6 V( R& m突变是肿瘤发生过程中的一种基础性进程，但是在何种程度上体细胞全基因组突变的速率，以及这种突变的具体分子机制，至今科学家们还并不清楚。# K1 n. @% D, z0 C( ~2 F/ w
在这项最新研究中，研究人员完成了一项包括 402 个全基因组的癌症比较，其中包括不同的儿童和成人肿瘤样品，也包括实体肿瘤和造血系统恶性肿瘤。7 j) t; g/ S. d# z* W+ t
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令人惊讶的是，研究人员发现许多女性癌症基因组中失活的 X 染色体会平均累积两倍，甚至达到四倍，达到与体细胞突变相同的数目。而在对健康个体造血干细胞/祖细胞（HSPCs），以及一个癌前病变的骨髓增生异常综合征（MDS）样品的全基因组测序分析中，研究人员却没有发现 X 染色体突变。/ S* O4 o( t/ Q* ?7 T" {
这些研究数据表明，失活 X 染色体的超突变是肿瘤发生过程中的一个早期和常见特征，这是由于异常增殖细胞中的 DNA 复制压力导致的。  Y) \1 Z" B, p/ q% ^
此外近期一组研究人员针对 12 种不同类型的肿瘤 3000 多个基因组进行了分析，寻找跨越组织界限的癌症共同特征。初步的研究结果揭示，超过 100 个基因组区域有可能包含从前未发现的药物靶点，并为建立一种新的肿瘤分类法从而让个别患者得到更为匹配的治疗，以最大的可能性缓解他们的癌症奠定了基础。
0 \2 L9 b: U$ t/ }8 f" W0 j3 {这一泛癌症研究利用了来自癌症基因组图集（Cancer Genome Atlas）的数据。这一项目由美国国家卫生研究院提供资金资助，旨在收集超过 20 种癌症，每种癌症多达 500 个肿瘤的基因组信息，其中包括所有编码蛋白质基因序列。
. C/ `3 W* p0 w, `. {* A1 _上述研究成果在线刊登在了近期的《Cell》杂志上。$ }% N$ R* @6 H  Q" h8 o8 D
领导这一研究的是德国癌症研究中心 Roland Eils 教授，Eils 教授是德国国际癌症基因组学协作组 ICGC 项目负责人，主要负责理论生物信息学部，她在海德堡大学的 BioQuant 中心组织建设一所世界上最大的生命科学数据信息库。! I# [" A  a) C8 S' S- B
原文检索：- `- a/ D) R! u' V: a! u- x( u. \0 M

) W& P+ K* l7 V1 I1 LNatalie Jäger, Matthias Schlesner, David T.W. Jones, Simon Raffel, Jan-Philipp Mallm, Kristin M. Junge, Dieter Weichenhan, Tobias Bauer, Naveed Ishaque, Marcel Kool, Paul A. Northcott, Andrey Korshunov, Ruben M. Drews, Jan Koster, Rogier Versteeg, Julia Richter, Michael Hummel, Stephen C. Mack, Michael D. Taylor, Hendrik Witt, Benedict Swartman, Dietrich Schulte-Bockholt, Marc Sultan, Marie-Laure Yaspo, Hans Lehrach, Barbara Hutter, Benedikt Brors, Stephan Wolf, Christoph Plass, Reiner Siebert, Andreas Trumpp, Karsten Rippe, Irina Lehmann, Peter Lichter, Stefan M. Pfister, Roland Eils.Hypermutation of the Inactive X Chromosome Is a Frequent Event in Cancer. Cell, 17 October 2013; DOI:10.1016/j.cell.2013.09.042
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