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[请教] 关于少量样本总RNA提取方法请教 [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2015-10-26 22:49 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
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最近流式分选了约10000个细胞,接下来提取RNA并反转录进行qPCR,请问大家有没有使用QIAGEN的试剂盒提过这么少的细胞,我的提取量只有3ng/ul,是否还有更好地方法适用于提取少量样本细胞?谢谢!
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沙发
发表于 2015-10-27 08:05 |只看该作者
细胞是不是太少了,看一下QIAGEN的试剂盒说明书所需细胞数,还有3ng/ul的量实在太少,应该很难满足后续实验要求,也可以看一下反转录试剂盒所需RNA最少量。
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藤椅
发表于 2015-10-27 09:30 |只看该作者
我记得以前用过Invitrogen的一个从少量细胞里提取RNA的试剂盒,楼主可以查查
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板凳
发表于 2015-10-27 16:55 |只看该作者
回复 wuhuaguo88l 的帖子4 B# m& @# a- h4 Q! p- M4 ~* @
4 X( p% |3 [1 Y! O% n9 X5 ]6 @
kit表明了最少可以低至100个细胞,但是也没有给出100个细胞能提出多少RNA。还有Bio-Rad的反转录和real-time PCR 试剂盒的template需要量都在pg-fg之间,按说应该能满足要求。但是实验结果不好,就是想知道在细胞量少的时候用kit提RNA是不是不如手提RNA合适呢?
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报纸
发表于 2015-10-27 19:02 |只看该作者
RNA纯度是多少,A260/A280的比值接近2.0吗?按你说的,至少QPCR会有扩增曲线的。
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地板
发表于 2015-10-28 09:14 |只看该作者
之前找试剂商定过Life Technologies得微量miRNA试剂盒,The Ambion® RNAqueous®-Micro Kit is designed for isolating total2 t: n- g; |" \# C4 [: ]5 K
RNA from micro-scale samples, including cultured cells(≤500,000 cells), tissue samples (≤10 mg), and microdissected tissue。2 N$ w5 X8 G+ U  ]. s! m3 c
你可以去官网上下载说明书看一下,具体步骤比普通的抽提过程复杂一些,专门抽提微量的RNA
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7楼
发表于 2015-10-28 10:05 |只看该作者
回复 yeahjl 的帖子* p7 e: M5 r1 C% }% f8 ^& X
4 Z% H  s+ M# @+ v8 J9 O
好的,非常感谢。请问您在使用这个kit的时候大约提多少细胞,能够收到多少的RNA呢?想借鉴一下您的经验。
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8楼
发表于 2015-10-28 10:24 |只看该作者
我只用了一次,剂量忘记了~,只是记得细胞数很少,实验室的RNA定量仪是国产的,貌似当时查的微量RNA需要用Nanodrop的定量比较准确
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9楼
发表于 2018-12-29 15:44 |只看该作者
楼主的这个提取量确实有点少,而且RNA容易降解个人觉得还要需要从提量下手,我们实验室用BIOG提取处理的样本量可以达到1500μL,我看到其他论坛做过的同学也提到用Trizol LS提取的
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