重磅:生物学家必备知识-RPKM和RMA的定量关系

Tlexander

小编发现生物学家特别关系基因的表达情况，但一般而言目前的表达数据主要有两种（芯片和测序），芯片数据采用的是RMA值表示表达的高低，但是测序数据常常采用RPKM表示。问题来了，那么RMA和PPKM在数值上的经验关系如何呢？4 _2 `. H' B1 `( }& D1 A- M" ~  C
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& [& U7 k5 L2 I0 A1 ?9 _1000<RPKM 被认为是高表达
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8 {! \3 u2 q, Y2 |: g* p现在清楚怎么解读测序数据的表达结果了吧，再举个例子：8 p3 X* X2 P. e5 }! [) ?

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' V$ O* t3 E9 }如图所示的这个基因UBQLN2 在大脑中呈现明显的高表达，在其他组织中是中高表达。在刚刚发表的Cell文章中，显示UBQLN2的功能缺失直接导致老年痴呆症，如此以来，大家就都明白了吧。# Y: A+ r; X$ C% ?1 f4 v
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转自微信号：表观遗传学快讯" I2 e1 W# f+ A; K5 g

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