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Cell stem cell最新文章:Highly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming     [复制链接]

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楼主
发表于 2011-4-8 09:25 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
本帖最后由 细胞海洋 于 2011-4-13 10:00 编辑 8 }5 Q8 z4 T. J" B
! X& S- D2 Y3 B9 H
Cell stem cell Volume 8, Issue 4, Pages Pages 376-388 (8 April 2011)   9 s- L: m( [: M3 b

: `; B( M1 N5 \, N5 {8 K; LHighly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming of Mouse and Human Somatic Cells to Pluripotency! k4 n. B* x$ l' l) ?
* B( n+ T: k: w" Q0 T4 b( Z3 b
1 ]! x2 `1 ^& ]) F! d3 j& g3 G: @
Frederick Anokye-Danso, Chinmay M. Trivedi, Denise Juhr, Mudit Gupta, Zheng Cui, Ying Tian, Yuzhen Zhang, Wenli Yang, Peter J. Gruber, Jonathan A. Epstein, Edward E. Morrisey
- U/ g6 [' J8 i0 C) d/ P/ ]; Q: @1 g* S  u4 G
Highlights, k1 Q& r+ k0 R& u' T3 p+ s4 ^
► miRNAs alone can reprogram somatic cells to pluripotency
5 t* N8 @2 v' ?5 K5 i; o► The miR302/367 cluster reprograms both mouse and human fibroblasts 2 i$ [: c( b+ A5 [& Q+ R* s0 J  P
► miR367 is required for miR302/367 reprogramming : t! Y3 d5 {8 I) l/ E# p
► Low Hdac2 levels are required for miR302/367 reprogramming
8 r6 M( g' w  v8 J: V4 j8 |8 D" q5 w3 J3 ~  M" u$ y( q
$ [7 `; T% G" c$ B2 g9 a. ?9 ]

# q4 V. L# J! D- x1 Q. m2 ]+ |
. c* _; J, O0 g; P) G3 r; n: z. y. p" p/ Z1 l$ o

) q3 Y2 z$ O# [3 _* P+ Q  D+ _现将这篇文献及附件信息贴上,欢迎大家进行讨论。; S8 P  V5 \  O. e% d2 X' @

' ?: E" K$ m: @! x! z% I海洋注:本文跟帖中有很多不同意见 本文是否存在作假可能 欢迎大家参与讨论 发表自己的观点
/ j9 _0 q! z* J
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沙发
发表于 2011-4-8 09:34 |只看该作者
2010年Science杂志总结出的10大科技进展中,有关细胞重编程的描述:
: _$ B5 ~6 m# l- O7 C8 @9 z4 I- D& T" ^+ ?2 I6 r
Souped-Up Cellular Reprogramming
3 o6 X* C% z: f" Y+ H/ H4 x, @+ D
Changing a cell’s fate by adding extra copies of a few genes has become routine in labs around the world. The technique,# e# a2 C/ \! A7 L3 o1 ^# j# J
known as cellular reprogramming, allows scientists to turn back a cell’s developmental clock, making adult cells behave7 U5 m. m& i7 d3 C
like embryonic stem cells (see “Insights of the Decade,” p. 1612). The resulting induced pluripotent stem cells (iPSCs)7 u, l* g4 m6 |1 w, ^
are helping scientists to study a variety of diseases and may someday help to treat patients by supplying them with genetically' e, H1 l/ d5 o& q$ J. n* L. i
matched replacement cells.
. y% J# c1 O1 y8 A* T0 x9 ^This year, scientists found a way to make reprogramming even easier using synthetic RNA molecules. The synthetic RNAs
- a, T. {" i! j& n9 X* V, `are designed to elude the cell’s antiviral defenses, which usually attack foreign RNA. The technique is twice as fast and 100 times1 T# P* j, j2 u& e1 K  W
as efficient as standard techniques. And because the RNA quickly breaks down, the reprogrammed cells are genetically identical
# `+ y" {& H9 q5 Sto the source cells, making them potentially safer for use in therapies.
7 y: y. f% }; T  b; ?
% M9 z4 L# z4 S3 OEarly evidence suggests that the RNA approach reprograms the cell more thoroughly than other methods do, yielding a
, q9 u# d, }) I, j. Ncloser match to embryonic stem cells. The method can also prompt cells to become nonembryonic cell types. By inserting synthetic
+ L$ r/ K, V' i3 dRNA into a cell that codes for a key gene in muscle tissue, for example, the researchers could turn both fi broblasts and iPSCs into muscle cells.
% J. a8 u  N0 D% n# _& E
编者对具有调控的RNA分子在细胞重编程中的作用的预言,这么快就实现了,呵呵,说不定就是文章的作者提前透露出来的消息呢。
+ }( r) ^2 k8 p3 j* F# I( P
# V6 m. u: i8 g+ r
" a$ D6 E/ l# X, A7 `1 G! C2 M9 E# O, @) g
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藤椅
发表于 2011-4-8 21:20 |只看该作者
本帖最后由 markllq 于 2011-4-8 21:21 编辑
  ]) P: ]+ Z& H2 l# h; Q9 ~$ S
! V' C0 U2 X$ P' A
. o' P: V7 h3 {5 |, @. |这篇文章中利用miRNA302/367 在除去SKOM的情况下直接诱导出iPS,而上个月中科院广州生物院裴端卿组在JBC发表利用miRNA302/367显著提高了iPS效率,两篇文章的区别就在有没有加四因子诱导,最后发出来的文章差别很大,国内科研在创新方面还是不够给力啊!
' _( k; A5 S! t- p+ j
6 S* ?7 ?! K+ R附上裴的文章:
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板凳
发表于 2011-4-8 23:56 |只看该作者
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1)两篇文章在如何诱导iPS产生的方法方面没有太大的区别,cell stem cell这篇文章用的慢病毒的方法,而裴用的逆转录病毒,后者在感染效率上会略输一筹的。所以前者的作者一直在强调诱导的高效性,两个数量级以上。
- O( v8 k/ R" T8 }2)纵观两篇文章,cell stem cell这篇文章在分析诱导出来的iPS表型marker上做足了功夫,包括including pluripotency marker expression, teratoma formation, and, for mouse cells, chimera contribution and germline contribution.这一点裴的文章似乎有点单薄,他们对MET似乎更情有独钟。9 Y4 z$ q, E- _# R0 u
3)cell stem cell这篇文章还对miRNA302/367发挥作用时的协同因素Hdac的表达水平进行了分析,从调控的网络性方面更深入了一步,裴做的也不错,找到了miRNA302/367的靶标。
4 O9 F4 Q7 g7 i  [总体上感觉还是前者的分析比较到位也有深度,我们能够做出来同样的结果,在这一步上可能就有所不及了,个人愚见,呵呵" z9 X- {* Y$ a7 k
0 }. w2 ^# j( Q: I! z' W
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报纸
发表于 2011-4-9 07:55 |只看该作者
本帖最后由 snokey 于 2011-4-9 08:06 编辑
* j' s# j6 o$ A& Q* F  \0 A& W( r+ Z9 V# {0 \
个人很不看好这篇文章,感觉too good too be ... 希望将来别的组能重复出来。
5 b  \: H1 w  j1 m. H第一:做miRNA302/367的Lab太多了,用把这几个microRNA组合起来一起转染细胞,或者用载体表达整个microRNA cluster的工作很多人都做过了,我都知道一个很有Credit的(常有Nature level paper)的组做了好一阵了,没有得到什么非常非常明显的结果。- @; ?2 E' w. v1 C4 j* P& o
第二:关于ES-like 克隆的统计,按文章的统计方法来看,他们得到的人的细胞中的诱导效率差不多为10%(如果我没有理解错的话),我除了惊叹还是只能惊叹。
- F, J; q* k2 K! v; i5 z4 L8 A. z第三:VPA的作用问题,VPA的作用其实很大程度上是HDACi-indepent的,个人觉得作者的工作只能部分解释MEF里VPA的作用。# X! P4 H1 Z. U7 R
第四:现在最流行的就是virus-free系统,病毒表达miRNA302/367可以work,直接转microRNA进细胞不就是virus-free/OSKM-free了吗?, Y, `1 c9 j& h' K
第五:哈佛那篇靠合成mRNA高效诱导iPS的文章其实也有类似的问题(too perfect)。据我所知有公司重复了,结果很不乐观,实际上那篇文章真的很难重复。我个人一直有个很大的疑惑,关于Fibroblast转染的问题。众所周知,Fibroblast很难转,做过的人都知道,即使用优化的Nucleofection程序,转染效率不过50%,哈佛那篇用RNAiMAx(其实是弱化版的Lip2000)居然就可以搞定了?(而且是那么长的cDNA) 那样Lonza最有名的产品Nucleofector早就没有市场了。
4 c; G4 S" L8 m2 D0 x$ R$ C# s! v! V2 }( }
个人觉得这篇文章值得借鉴的地方是找出了一些VPA可以提高诱导效率的解释。6 V, O( P4 b+ `, G# l
时间/重复是最好的判断标准,希望我的观点是错误的。
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marrowstem + 10 + 10 我很赞同
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地板
发表于 2011-4-9 09:08 |只看该作者
我们也试过哈佛的那个方案,很难重复,文献就是个文献,科研还得自己做
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发表于 2011-4-9 09:39 |只看该作者
楼上的,你打算重复这篇文章吗?

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发表于 2011-4-9 14:49 |只看该作者
有这篇同一期的文献没?
! z! v8 x3 v9 [/ vDefects in Trophoblast Cell Lineage Account for the Impaired In Vivo Development of Cloned Embryos Generated by Somatic Nuclear Transfer
% y6 d+ R" h5 Z- V% oJiangwei Lin1, 2, Linyu Shi1, Man Zhang1, Hui Yang1, Yiren Qin1, Jun Zhang2, Daoqing Gong2, Xuan Zhang1, Dangsheng Li3 and Jinsong
) N5 ~# @6 i! h! }% N
0 T- a2 O; V- V- @# Q链接附上:http://www.sciencedirect.com/sci ... e8161f55c5940736b7e
. w0 B% r7 [! X, H( r# M
) ]/ J" O/ ?# B, S各位朋友:帮忙下载一下!

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发表于 2011-4-9 23:01 |只看该作者
回复 ambassador 的帖子- u$ N/ }+ x: h# v) W! J
: T3 t9 Y: K( p2 _
Defects in Trophoblast Cell Lineage Account for the Impaired In Vivo Development of Cloned Embryos Generated by Somatic Nuclear Transfer
+ _/ }/ ?& F" a- y) |3 q8 [) ?( x' \- T1 T

' t2 ?* P# y6 P  R4 p" K
  H1 e# z# Z: D; ?
1 q" C* }4 k# P/ X' u# L6 C8 \6 l- x- d8 P: ?$ ]7 M4 c
下载好了,楼上的可以下载了0 i% z. {/ u+ f1 ?& P: Y6 i
: N3 b  I# _% o; b& {; [

6 d5 E2 ~3 y6 `0 f  J: A
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ambassador + 5 + 10 谢谢你的帮助!

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发表于 2011-4-9 23:08 |只看该作者
xyklmu 发表于 2011-4-9 23:01
4 x! ]! z$ k9 o# C) A( V回复 ambassador 的帖子" Y* _3 f% z  a/ N

- h3 u( J$ @1 D# ^2 [9 ]! P1 Q  t7 ADefects in Trophoblast Cell Lineage Account for the Impaired In Vivo Develop ...
8 ~  p) L$ e8 B* P& s" u
谢谢啊!虽然同学发给我了。。。
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