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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑
d }+ Q' h1 i# d! h+ x- N) z% p" o0 E+ Q. b) }, c* P0 b. F. H
这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。0 e0 w% P. K$ v3 c. i
我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。
; _$ i4 o9 Y1 U9 u6 I5 d+ [TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
1 R, @% g e) T& y- j最简单的用法如下 D% H+ q: n4 J) v: ^4 J( x# U. F2 e
如图1：打开网址后，点击 site search
6 C }7 b* F1 [7 ]* U如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit% M; i' g, g$ a% X
如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。
`0 X: q$ n8 i/ c8 l4 _$ r) ]* y如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
2 X% }2 n+ J+ d/ `4 e' n& t6 t
$ ^( z) [8 F. g1 G8 z7 g8 s' u其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
