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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑 # L) M. _( e- v2 t0 U! {
# |8 K6 p' O$ b: x这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。; o; @: G* }: }. H" o
我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。5 W. L2 `/ B/ N1 ~6 _
TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess / i: A4 P* L, O5 h9 f
最简单的用法如下0 m/ t" d! l8 H( {) @- ?( r6 p) E
如图1：打开网址后，点击 site search) |8 W2 w+ d( i$ G, ]
如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit, s- H5 E+ B' b# R7 ], u( ]' |( W
如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。) O3 o* }* g$ p! r
如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。/ Z& P# I8 s% R2 Q/ u9 I
: c5 K4 |/ j% e; J. t* N" ^其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
