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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑 ' O$ g9 [6 {: z3 B
# p% S9 r3 p( @$ q, d/ o- ?
这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。
% @5 y1 A4 [9 D我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。
3 N6 c! n" E7 b5 N/ pTESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess : p% _ O: ^; v; r9 ~2 ]1 F% I
最简单的用法如下% n L% [7 J9 \3 W m2 N3 J0 @% e, W. C
如图1：打开网址后，点击 site search
& c8 p" Y* P7 l6 _7 p- d如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit
# P# w8 z: N% Q' u; R$ P如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。% I. T* F4 H( P5 n1 f8 q& B* M; I2 n' j
如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
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$ N1 [$ Z4 b& u其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
发表于 2012-9-24 08:16
