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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑 / N$ W8 r# s0 d! ` z; Y9 y
9 N: | ?2 q4 {0 e( L$ F& C这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。# U, ~$ H. l% ]0 \( L4 V( v
我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。/ g; A& G$ Q J6 J2 B" p3 k$ e
TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
3 S/ W, b% K* q. P. d最简单的用法如下, F) K+ Y: t+ F8 B) t
如图1：打开网址后，点击 site search( c$ S. p' U H9 P+ [
如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit
# V$ N. n0 W( i7 e+ {( l5 z* [如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。& c( z& O6 t8 Z2 o* E
如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
1 `' w# @6 Y8 [4 ^, w5 V' s% @8 w# T
其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
