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[讨论] nanodrop2000   [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2012-5-4 09:18 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
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大家做蛋白定量到时候,有没有用nanodrop2000(protein A280)测过浓度的?出来结果什么情况代表可用。
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沙发
发表于 2012-5-5 13:01 |只看该作者
都是在用nanodrop测,而且很准的,一般看它的扫描图谱,在A280有很好的特征峰就可以,一般为了达到精确定量结果,我们会用盐酸胍对蛋白进行变性处理,将色氨酸等特征吸收峰的基团暴漏出来,这样结果是很准的!
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藤椅
发表于 2012-5-5 20:01 |只看该作者
langziforever 发表于 2012-5-5 13:01 8 A* q0 l! _+ [3 f' e+ D" y
都是在用nanodrop测,而且很准的,一般看它的扫描图谱,在A280有很好的特征峰就可以,一般为了达到精确定量 ...
7 q3 q# V3 ], Y
您好,可是我测出来的又两个峰值,近A280一个,近A235处一个,还有个A260/280比值,这个比值有什么讲究吗?

M0XSD0CSG~8{@_NX2KQIZ5I.jpg (26.92 KB, 下载次数: 343)

M0XSD0CSG~8{@_NX2KQIZ5I.jpg

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板凳
发表于 2012-5-5 20:05 |只看该作者
回复 langziforever 的帖子3 z0 N4 c# z; E0 U
9 w9 W' m2 N9 @- o
还有我是直接测的,没用盐酸胍处理,不知这是怎样做的,可以发送一个protocol给我吗?谢谢

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报纸
发表于 2012-5-5 21:00 |只看该作者
测蛋白浓度应该做标准曲线吧?这么测准吗?
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地板
发表于 2012-5-5 21:30 |只看该作者
我们实验室,没有啊

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7楼
发表于 2012-5-5 22:10 |只看该作者
回复 如来的观音 的帖子
5 a6 k0 p' ^+ ^  u& ?
2 P' P2 ]0 }2 e纯蛋白的A280/A260应该=1.8,低于这个值说明有核酸污染,你的A280/A260=1.3,蛋白不纯,有核酸污染。DNA的A260/A280为1.8~2.0,而RNA则是2.0。另外,用摩尔消光系数计算蛋白浓度比较准确。
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8楼
发表于 2012-5-5 22:11 |只看该作者
回复 如来的观音 的帖子
8 Q% W1 ^) \. h3 g9 O
( F( ~: y7 O- F0 V. p纯蛋白的A280/A260应该=1.8,低于这个值说明有核酸污染,你的A280/A260=1.3,蛋白不纯,有核酸污染。DNA的A260/A280为1.8~2.0,而RNA则是2.0。另外,用摩尔消光系数计算蛋白浓度比较准确。

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9楼
发表于 2012-5-6 13:14 |只看该作者
回复 shiyi 的帖子
& C, d8 K. Q0 a/ w  H! P7 y- d, n: O6 l" p) o
我测了两遍,一遍1.3,随后的是1.7,看来误差也挺大的,再说就算核酸污染对western有影响吗?
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10楼
发表于 2012-5-6 15:51 |只看该作者
回复 如来的观音 的帖子
+ q! P1 @: l* B# d) i8 m
0 o, Q6 x7 ]4 Q核酸污染对western的影响倒不大,不过你的浓度测不准的话没法做蛋白的定量分析啊(没法确定蛋白的上样量)。这种情况我建议用brandford法测浓度确定蛋白的上样量。
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