请教高手: IPS诱导?

sammie

1. 为什么现在大家做IPS都倾向于用Yamanaka的四因子，而不是用Thomason的四个因子，不是说KLF4和C-MYC是癌基因吗？为什么不用NANOG和LIN28呢？9 G- h5 O& S  ~. b) A2 B4 E* i* G
2. 用于诱导IPS的病毒是用逆转录病毒好呢还是用慢病毒好呢？？

daytoday

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" l0 M. O% q! t' }/ _( T+ r. \& W2 h1 q2 q* n8 S7 v5 \
美国密西根州一个不起眼的实验室，华人老板，他做了20年的蛋白结构
; R1 q: [& ?; |5 \& D只用SOX2，oct4和Nanog，诱导5天后撤掉蛋白

xiphias

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4 E" r( A4 s# ^: r9 L; q+ u9 r0 ~5 A2 W0 j0 t
牛啊。用蛋白做的，可以透露下你们是那个实验室吗？ 用的Cell stem Cell文章的条件吗

daytoday

我们是计数重编程之后ips细胞的阳性细胞数与最终总细胞数的比例
1 j( A: y: n7 t4 R, Q我们不使用feeder

birdflubirdflu

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: }6 D5 a; c( s2 }  q. y( e- A4 y9 p3 l% l( l( L, o0 y/ h
你说的是正确的，但conversion的过程细胞会增长也是一个事实，重编程的完成时间点是人为定的，我们只是遵循计算的原则，所以克隆数目的多少在一定程度上也是可变的。

ghfvcat

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! u4 k) E: _& i- S, A
1 N: i* {; l2 B  ]: m  l  v9 [: m效率不应该是最后形成的克隆数目除以铺在feeder上的原始细胞的数目么，这个算什么效率？多让iPS长个两天，这个效率可以翻几番吧

birdflubirdflu

回复 daytoday 的帖子' P, s. |. j; M1 T8 R9 J5 `" t( b

+ z( [7 Q2 L; ?4 c8 y我明白。 因为你算的是最终ips除以最初被诱导细胞的总数，而这个conversion的过程，细胞是增长的。有可能一个fibroblast诱导成了两个ips。很多group都是这样算conversion efficiency的，见怪不怪的，超过100%的conversion efficiency都有。

daytoday

回复 ghfvcat 的帖子2 x+ d2 E! h3 d; E9 [

. `5 w- M9 |. v% mI'm dead serious

birdflubirdflu

回复 晴朗 的帖子. u' I. H5 m6 @/ N0 z: K: |0 z
, Y8 a! \0 ?$ _! N/ [) o0 n  R/ d
能少用transcription factor还是少用了，毕竟大家都在优化，寻找一个最好的cocktail。

ghfvcat

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  d+ B  o0 n! _" G0 ]" R
" C( a/ k+ u5 R$ f; XiPS诱导效率99%以上? are you joking?