怎么通过基因表达来检测细胞凋亡？Fas和Bcl2，bax，BclX能不能检测？

jiojoo

- t" h0 R- C( ]1 m  [; m; r2 ]
& J; \3 y8 ]' v2 {- J( L0 K因为样品已经没有了，只是还有cDNA样品，想顺便检测下细胞的凋亡情况，所以就定了几条引物跑了个qPCR
7 {1 M, V) ^7 G3 G' p, H结果如下图
9 Y- c# B- I4 y* t3 a7 jB组是对照，三个处理组，分别是D组、F组和H组，3d和5d两个时间点# @% n3 \1 v& q" T1 \+ f& f' \0 g2 z

2012-7-17 23:37 上传

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: K6 u- |  `& U0 M4 l
这张图片能不能说明一些凋亡情况的？6 W0 F9 [4 d' k3 }( b
或者需要做哪些基因才比较好？% r7 z3 h. Q% y' P/ t5 p& F2 V
期待大侠的意见，非常感谢！

jiojoo

回复 希望之光 的帖子3 D8 y: V2 Y+ h
, ?' L8 ?1 o6 t( U+ F$ m* J6 ]( |
感谢回复

希望之光

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/ W' o# r9 e# c( V8 j' ~: b: {  [, b" L
Fas通路 配体 Fas配体 ·
: I0 D, w6 w' l1 G) T2 l           受体 Fas受体 · 2 ]7 E: E' Z) g0 W* F/ y
           细胞内 死亡诱导信号复合体 ·DAXX ·ASK1 ·FADD ·半胱天冬酶8 ·BID ·细胞色素C ·半胱   天冬酶9 ·半胱天冬酶3 ·促凋亡: :BAX ·BAK1/Bcl-2同源性拮抗扼杀剂 ·Bcl-2相关死亡助剂 ·抗凋亡: :Bcl-2 ·Bcl-xL · + Q& ?5 \/ ~# P( l* R7 F
6 F! d$ R7 a8 d2 P& g8 `( }. I
6 [' E& o* s! m5 ~( q
TNF通路 配体 肿瘤坏死因子 · / X+ }- y' U% C3 A  }
$ R' h4 A8 F+ q9 S' R* O
受体 肿瘤坏死因子受体 ·
3 Z0 S( C; M$ [) E0 V; U. f
% q) s4 `. }1 W4 A) C) r% x细胞内 TRADD ·* n- P5 k6 d6 C# O; T+ O
FADD ·半胱天冬酶8 ·半胱天冬酶3 ·BID ·) [3 {. R( N0 k- E
TRAF2 ·ASK-1 ·MEKK1 ·IKK ·IκBα ·MKK7 ·JNK ·NF-κB · / Q& c+ m; D( ~

. I5 T" t5 l8 Q
" P4 }4 v, t$ [其它 细胞内 凋亡抑制因子 :XIAP ·NAIP ·生存素 ·c-IAP-1 ·c-IAP-2 ·
5 K3 @6 v, m' q. t' g细胞凋亡诱导因子 ·
& O* _* X! T! ~; ^2 w6 d" F 还有caspase家族的几个都可以  T* Y) t0 p5 p! |' i
4 ?* x$ E+ e0 `5 p# M

jiojoo

回复 妖妖空 的帖子
6 f4 n, [0 `' p) j5 m, I4 w; t/ s) D6 ^
感谢回复* d. M0 q" ?- G8 F
看了你的回复，及之前看的文献，我大致这样认为，Fas和Bclx及Bax是促凋亡的，Bcl2是抑制凋亡的，不知对不对" {7 v$ n/ r; [( l: N
那我是应该将处理组同对照组比呢
( D/ Z6 U4 x% g- _+ B, v还是应该比较同一组别不同时间点间基因表达的变化呢
" x* U" N! D- k* j8 e8 k" d& ]
& q; E5 [0 G  \8 O0 H1 N) J5d时，H组的Bcl2相对于对照组下调，而Fas则上调，是不是凋亡的趋势？

jiojoo

回复 yuhaoze 的帖子
7 A3 Q% j+ l( t+ Y! f$ N% f5 l2 [) a  d) S4 ]
版主所言吉是，十分感谢

yuhaoze

不是刚才说了，8/10/3先检测这三个。还是先看看文献吧，弄明白了再做，要么耽误时间耽误金钱，虽然看起来你们不差钱，不过还是磨刀不误砍柴工吧。

jiojoo

因为我不是做药的，观察到的现象是5d开始死，7d基本就OVER了

jiojoo

回复 yuhaoze 的帖子
+ u: |/ L1 L* |5 b7 C
. b+ W$ g( d0 t# Z5 A0 ?/ P+ L) |自己设计没问题，只是能否提供确切的几个基因名字之类的呢" j/ e* P$ Y6 a2 X$ j
caspase似乎有很多？

yuhaoze

基因倒是有，但引物得你自己设计，我以前设计的找不到了。就检测caspase吧。7d才死光，是不是太慢了

jiojoo

回复 希望之光 的帖子3 H7 V3 u- Y2 Q3 u% S# q8 u. Y

8 P3 y0 P3 y! @  I* B6 h感谢回复，因为我并不是做凋亡这一块的，凋亡相关的东东完全不懂。
& f2 L; e$ d7 v我只是看到其中一个组细胞7d之后都死光了，所以就想看下是因为坏死还是凋亡，另外，因为现在的样品还有cDNA，所以就只是想做个初步的实验来大概地判断一下
6 L1 K  _! O) I' H( w$ w另外，图中Bclx和Bax标反了，不好意思~
8 p4 f3 B8 E4 F9 C8 @另外，您能否提供一些更好的基因来检测是否有凋亡的迹象呢？% F9 k1 e; @* s