干细胞之家 - 中国干细胞行业门户第一站

 

 

搜索
中源协和

免疫细胞治疗专区

欢迎关注干细胞微信公众号

  
查看: 72675|回复: 16
go

[请教] 【跪求流式大神】分选的流式图总是shift [复制链接]

Rank: 4

积分
1013 
威望
1013  
包包
2639  

金话筒 优秀会员

楼主
发表于 2015-3-9 11:12 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
本帖最后由 w343989328 于 2015-3-9 11:12 编辑
' u: Z, r1 K6 _* C0 Y5 b2 Q& o% k
先说一下我实验的一些情况,我要从组织中分选一类细胞,两个表面抗原,一个正筛一个负筛。用的都是间标的抗体,杂一二抗。
5 L" J3 t" l8 ]+ U4 xA抗体来源于大鼠,连着生物素的单抗,用Alexa Fluor 488标记的链霉素作为二抗;
$ Z0 K: ^( h  ?# |) O1 ]; UB抗体为兔多抗,我用donkey anti-rabbit Alexa Fluor 555作为二抗。
, s0 g4 }+ e- m& ?$ v& M& w6 A学校的流式分选仪器是BD的AriaII,有358nm, 488nm, 633nm三种激发光,因此我这两个抗体只能选择488来激发。
# Q7 E: v, [' r$ t/ M: N4 Y/ v3 t+ T% g# ^% @4 O
实验的步骤大概是这样子:组织经胰酶+DNase消化,过滤得到单细胞悬液,镜检、计数。调整细胞浓度到1*10^7cells/ml,加入抗体。冰上同时孵育两个一抗一小时,洗两次,敷二抗半小时,洗两次,上流式前5min加入Hoechst33342,以便在区分掉死细胞。# _0 {; R4 n3 L4 |

# }' U3 h) x# ]以下是几次重复的结果:
) P% ?, d# B' s) s0 W, Q9 z8 c: g& q 1.jpg
  r7 V4 T4 s- D+ v) f8 k首先是control组,不知道上头那坨东西是什么细胞(肯定不是死细胞,而且我抗体也不会加错),几次重复都或多或少有这么一群东西;( o. M5 b# l+ W  ^8 m
其次,FITC通道勉强能有一群细胞出来,但是整个population,包括nagetive cells,都往右偏;
! ^4 d/ N7 t! Z, U% H# Q: }, D而PE通道则整个群往上走,导致我没法分出细胞群。9 n6 A7 Q9 T  [$ ?
2.jpg
9 V& _2 l. k, @9 ~# l% l% o这次结果好很多了,单独PE通道能分出群,但是一旦加入A抗体,则整个群依然往右shift。我这里要强调的是,基本上这个领域内所有的文献都报道这两个抗原属于两种细胞,而且我自己IF的结果也显示两种荧光并不merge,所以这里理论上不存在说细胞同时表达两种抗原的可能。: }# o2 {* _3 X% @* _, O" ^. {
但是呢,加入A抗体后,基本所有的细胞都会往右shift,所以将PE阳性的细胞带出我用control框出来的门P4。我个人觉得这里应该不能用补偿把细胞往左调吧?
( c: ], j& V" ?0 o* a 3.jpg 3 P2 W; N1 G9 R- I5 W1 h
我重复了一次,和第二次的结果一样,细胞都是往右偏。6 i  ^7 g5 _/ O" x( n
, M5 a' k6 D* J" `) o
一开始怀疑A抗体浓度过高或者孵育时间太久,但是减少浓度或者时间并没能改善结果。
. [2 I$ i4 C. y$ K
/ C# d$ _9 a7 B+ C6 i# G不知道有没有大神能帮忙解惑,不胜感激!
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 10 + 20 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 10  包包 + 20   查看全部评分

Rank: 2

积分
116 
威望
116  
包包
291  
沙发
发表于 2015-3-9 11:26 |只看该作者
1. 重做荧光补偿: F5 v3 b% R$ ^. v2 ?- ~, A
7 p1 g. d4 e7 n7 U* i9 o) w$ s: f& u6 {
2. 洗涤流式细胞仪液路系统5 q! c6 L. H7 O' F# V; E2 Q

; P$ y; C" l. H; P) ], W个人建议,不一定对。
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 3 + 10 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 3  包包 + 10   查看全部评分

Rank: 4

积分
1013 
威望
1013  
包包
2639  

金话筒 优秀会员

藤椅
发表于 2015-3-9 11:37 |只看该作者
回复 mantianfeiyun 的帖子
; d: [! `& p. i" w6 S
% J  _5 Y$ U% u1 i3 B/ W* k上面的图都是没有设置补偿的。
( N& D5 y  y9 d. ~( n有一点我不是很明白,我这样只是单个通道的shift,这样调补偿没有意义吧?
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 1 + 5 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 1  包包 + 5   查看全部评分

Rank: 3Rank: 3

积分
434 
威望
434  
包包
1234  

金话筒 优秀会员

板凳
发表于 2015-3-9 12:34 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
单标,不需要补偿。$ y9 e. V' l3 D- h0 }) L
FLOWcheck、FLOWset都做过,没问题吧?) Q  t4 u* M  {% G' I) ^1 }
你检查下你的数据采集时间,是否跟你的上样浓度符合——比如上样量为80-100万个细胞,体积300-500ul,那么数据采集速度大致在500-700个/秒,搜集1万个数据也就10来秒的时间。如果采集时间为30-40秒,那就是有很多数据都被仪器当噪音屏蔽了,说白点就是FS阈值设定高了,你当前分析的都是些肥胖细胞,所以图形shift。贝克曼的仪器一般默认是100,BD的不知道,你将它设定低点,再检测。
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 10 + 20 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 10  包包 + 20   查看全部评分

Rank: 4

积分
1013 
威望
1013  
包包
2639  

金话筒 优秀会员

报纸
发表于 2015-3-9 15:12 |只看该作者
回复 dollar007 的帖子
- W; c0 i/ Z! B5 ^  T/ a, d# T9 {1 `9 W: o. X& L
谢谢您。您说的FS阈值是指什么呢?/ O9 X: K* x" V( ^  T! u
我用FSC SSC框下来的细胞是同一群,我不是很明白您说的肥胖细胞是指。。。
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 1 + 5 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 1  包包 + 5   查看全部评分

Rank: 4

积分
1013 
威望
1013  
包包
2639  

金话筒 优秀会员

地板
发表于 2015-3-9 17:06 |只看该作者
顶一个

Rank: 4

积分
1013 
威望
1013  
包包
2639  

金话筒 优秀会员

7
发表于 2015-3-9 21:28 |只看该作者
求大神。。

Rank: 3Rank: 3

积分
434 
威望
434  
包包
1234  

金话筒 优秀会员

8
发表于 2015-3-9 21:41 |只看该作者
流式通常用FS设阈值,贝克曼的通常这个值是100,即FS=100.仪器默认FS值小于100的信号为噪音信号,不纳入分析。初设定参数时,如果不清楚此细胞的特性,我们通常把阈值由低调到高,调到什么值合适呢——调到FS/SS散点图左下角能略看到一些碎片即可。如果阈值设定过高,那么碎片群你图上看不见,同样的有部分细胞信号也被屏蔽了。我以前做CIK双阳检测的时候发现的这个问题,上样量与检测速度不匹配,后来发现是这个问题,阈值采用机器默认的FS=100,在当时的电压下,80-90%的细胞都被漏检了(被仪器屏蔽了,认为是噪音。)当我把FS调整为50的时候,这部分数据才得以在图上显现出来。“肥胖”细胞是我做MSC时爱用的口语,通常MSC“干性”好时,细胞很幼稚、细小,表现为FS和SS值都很小,而一旦MSC成熟或者衰老时,细胞会变得很扁平、肥大,此时FS和SS值都很高。通常而言,肥大细胞即尺寸大,内容物更复杂、丰富,表现为FS/SS值更高,更易被检测出。' Z& R7 d' H) n" H
希望对你的实验有帮助。
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 20 + 30 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 20  包包 + 30   查看全部评分

Rank: 3Rank: 3

积分
460 
威望
460  
包包
1303  

金话筒 优秀会员

9
发表于 2015-3-10 09:20 |只看该作者
和机器 补偿什么的没有关系 是细胞本身的原因 你做的应该是上皮类细胞 如果是血液系统一般就不会
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 3 + 10 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 3  包包 + 10   查看全部评分

Rank: 4

积分
1013 
威望
1013  
包包
2639  

金话筒 优秀会员

10
发表于 2015-3-10 10:07 |只看该作者
回复 dollar007 的帖子
5 {# Z6 E4 }8 `3 D0 n2 K. _+ T
谢谢你!可是我觉得这里的shift跟SSC FSC两个参数没太大关系啊。
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 1 + 5 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 1  包包 + 5   查看全部评分

‹ 上一主题|下一主题
你需要登录后才可以回帖 登录 | 注册
验证问答 换一个

Archiver|干细胞之家 ( 吉ICP备2021004615号-3 )

GMT+8, 2026-1-13 11:30

Powered by Discuz! X1.5

© 2001-2010 Comsenz Inc.