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楼主: gxbzjznn
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[请教] 定量试验扩增曲线? [复制链接]

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发表于 2016-4-12 10:41 |只看该作者
回复 sithbj 的帖子
5 V0 K( C5 ~' D! G& S) q- H9 @0 F* |! g# c
逐个回答你的问题:1.条件确定类似(cDNA浓度几乎一致都是按照定量试验要求的在100-200ng/ul、反应体系以及加样顺序全部一致)。 2.引物确定加了的(两次实验用的同一管引物) 3.2X里面的荧光染料也是SYBR GreenI  但是你说的我还是不明白,求指点。。。。
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发表于 2016-4-12 10:46 |只看该作者
溶解曲线还不错,引物应该还可以。如果是扩增曲线感觉不好,有问题的话,可以将样本10倍往下稀释成3-4个梯度,然后做QPCR,类似于绝对定量,看一下扩增效率怎么样,内参也要用相同方法测一下,若是扩增效率在1.9-2.1之间,实验结果是可信的。
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发表于 2016-4-12 11:35 |只看该作者
回复 wuhuaguo88l 的帖子, E5 t  s7 A( l3 `$ N, H' Q/ E
. E5 w) J3 g5 G% K7 y  f
扩增效率怎么计算的?

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发表于 2016-4-12 11:41 |只看该作者
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回复 wuhuaguo88l 的帖子8 P0 l2 C+ }( Y2 v
3 x& |  O* r- `( j2 w
我们实验室用的罗氏的仪器,计算出来的扩增效率都是在90%-120%之间,都是用百分比表示的。您说的这个1.9-2.1也是用罗氏的仪器做的吗?
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发表于 2016-4-12 12:45 |只看该作者
罗氏LC96或LC480只要看一下标准曲线就可以了,我和你其实是一个意思,理论上扩增是2的n次方,实际实验是(1+e)的n次方,e是扩增效率,应该在90%-120%之间是可信的
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发表于 2016-4-12 15:33 |只看该作者
回复 wuhuaguo88l 的帖子' Y6 M3 z/ r8 i% P

* D. L! B% E; U4 r! `5 W; w对啊 已经根据公式计算过了 80-120%之间都是有效扩增 90-105%是优化扩增 我们的这个扩增效率都是在90-105%没有问题 而且标准曲线的回归系数都是大于0.99  就是不知道问题出在哪里了
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