关于iPS重编程机制的个人总结，欢迎大家拍砖！

shuc.chen

学习了，文中“我们好不容易将导入的因子从四个减到一个，现在却要增加因子。更多的因子意味着更大的插入突变的可能，因此安全性降低。因此，通过外界环境的变化，筛选小分子似乎显得更有价值。但是，重编程机制的阐明能够为将来用蛋白质和小分子诱导提供理论基础。”看的我比较兴奋，我是搞蛋白与小分子相互作用的，同时也研究细胞内的信号网络，筛选特异性的小分子，通过作用于某几个靶蛋白而实现ips确实可以尝试尝试

随风的天使

很不错呀，楼主厉害！

flydayzhu

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枕头和书

大三的，好牛

flydayzhu

机制探讨第三段中p53应该是抑制细胞分裂而不是促进细胞分裂

flydayzhu

机制探讨第三段中p53应该是抑制细胞分裂而不是促进细胞分裂8 E7 M" L' `* j0 G- H: r9 u
flydayzhu 发表于 2010-7-7 09:07

$ s7 q. p# ~) U8 ~6 e
或者说抑制p53能够抑制细胞分裂，楼主应该是漏词了

qizhi502

回复 1# 张也行 ) s" t( E) h8 u) @, ?

5 l1 i& J" {5 E1 Y8 @9 w5 O4 X
1 w6 F$ F3 _9 h: j+ |, a; h* K# p4 i    针对楼主第一步所说表观遗传变化，简而言之就是核小体构象的变化使基因处于易表达的开放构型或处于抑制的关闭构型，而构型又受DNA甲基化，组蛋白修饰和转录因子三者的影响，这三者相互作用，如作者所说Oct4能结合到BAF复合体上，使Baf155替换Baf170，从而使分化细胞特异性的BAF复合体转变为esBAF。esBAF复合体是一种chromatin remodeling complex，与ES多能性的维持有关。他能使染色体的结构发生变化，以利于基因的激活，同时他能与Oct4结合，促进Oct4与靶基因结合，从而促进重编程的过程。但是这四种因子导入之后的起始事件是什么，过量表达，oct4自己不行，其他的也有，所以此时不仅与这个BAF有关，其他转录因子也再调节其他多能因子激活，但是体细胞分化基因却被抑制，说明这些因子也参与了甲基化的过程。怎样作用的呢？  Y6 f  K; v7 |/ M7 m6 N# v
    此外作者所说核移植是主动去甲基化，这点赞同，但说到重编程更快，更彻底不敢苟同。核移植虽然可以重编程但是对印记基因的改变甚小，将孤雌干细胞作为供体进行核移植依然不能改变其印记基因形式，所以不能生动物，不过最近上海生了，但是他们是通过无限传代改变的印记基因状态。3 V  X2 D$ R5 H# m* |
    4n-ips和2n-ips的目前所能检测的区别就是dd区（12qf1）开放与关闭，目前的结果是供体开放时产生的ips才能4n嵌合，这也就说明无论多能性因子还是核移植环境都不能重编程这个区域，是根本不能还是在某些因子协助下可以重编程。这也就涉及印记基因的重编程和正常基因的重编程机制不同。

张也行

回复 27# qizhi502
$ r1 O+ r$ P5 \. O8 ?: s& e$ R7 `

5 i, _' y, d: T+ S    关于核移植的重编程更complete的问题，文献Aberrant silencing of imprinted genes on chromosome 12qF1 in mouse induced pluripotent stem cells从形成嵌合体的效率来看，ntES确实比iPS效率高，和ES更相似，所以，如果从12qF1激活这个标准来看ntES确实比iPS重编程完全，这也是原文说的。另外，核移植获得ES细胞的时间确实不iPS短，是不是可以说重编程更快呢？但是，仅仅从12qF1是否激活确实值得商榷，毕竟是一个实验室做出的结果。
* g& k3 e! i5 g' d怎么说呢，我觉得重编程机制是一步一步明白的，从最初的一无所知到现在的初露端倪，我们的认识在进步。

张也行

回复 27# qizhi502 ( I, O2 x  o* Y/ x! @5 C& c
还有您说的“但是这四种因子导入之后的起始事件是什么，过量表达，oct4自己不行，其他的也有，所以此时不仅与这个BAF有关，其他转录因子也再调节其他多能因子激活，但是体细胞分化基因却被抑制，说明这些因子也参与了甲基化的过程。怎样作用的呢？” 你说的没错，重编程过程是一个global的过程，四个因子肯定要与其他的因子（表观因子，转录因子，还有最近证明的信号通路组成因子）相互作用，但是就目前的研究结果来看，BAF复合体是最近发表的最有说服力的例子，还会有更多的因子被发现，这是肯定的。
+ O: Y0 j& s- s3 H( w: E* `* l+ P8 V1 f! e! u' T( V. P: {' V, V
还有您说的重编程的起始事件，现在我也觉得仅仅从表观遗传上解释也很欠妥，比如，裴端卿教授最近不是证明MET才是MEF重编程的起始事件吗？但是，我觉得裴教授仅仅从四个因子对TGF-β通路的作用解释四个因子的作用也不是很全面，毕竟TGF-β通路（或者说MET）不能涵盖所有的基因和所有的现象。2 @  f8 x+ b6 l% {  X

  X- G0 l% z; x# I3 a( d9 z% Y所以，我觉得最安全的解释就是导入的四个因子和各种因子相互作用，改变了基因表达，逐渐实现了重编程，但是这有什么指导意义呢？正像您问的“怎样作用的呢？”

张也行

回复 26# flydayzhu
) @7 j) Y3 \, \3 t; \1 n! D9 n* O+ f% p

) T! Q, U3 H! m. Q. f" }    Thank U！:)