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本人最近的试验遇到一些问题,望各位战友能多提宝贵意见。
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自己想获得几种目的蛋白(四因子OSKM蛋白),做一些蛋白的功能试验。正在用pET-28a表达系统(一种常见的成熟的原核表达系统)表达目的蛋白(OSKM),前期已成功获得了pET28a+目的蛋白基因 的质粒,转化到BL21感受态中,经IPTG诱导表达后,想验证诱导表达是否成功了,遂做了一个Western Blot。由于第一次做WB,走了不少弯路。结果和过程如下:
1 s9 v1 D% N. X6 Q' K; K3 [7 X e4 T v. d0 g
1.蛋白的提取:第一次发现提取的菌体过多,裂解液加的不是很多,可能存在裂解不充分的可能。第二次减少了菌液的用量,加了足够的裂解液,进行了充分的裂解。; B$ G X3 M9 J( T6 }2 m
备注:裂解液是碧云天的,主要是用来裂解细 胞的,后期考虑用超声波裂解的方法。裂解液中加入了PMSF$ s! w% ^8 V) c7 b; E
疑问:裂解后的菌液,经离心取上清,发现上清很清亮。裂解的整个过程中也没有发现粘稠状的液体,这正常嘛,不是说可能有DNA嘛???/ q- e2 R1 K# L' Q# p
2.蛋白的变性:加入蛋白上样缓冲液,并在沸水浴中加入5分钟。* H: F7 X* L3 i* u. }+ W& v4 o
疑问:我看有些地方是加热10分钟,想问下这个可影响后面的结果???
" \5 r6 F3 n0 a/ H' O* o) V0 _3.SDS-PAGE:首先对上述样品跑了一个SDS-PAGE,进行考马斯亮蓝染色。染色的结果发现有很多的条带,在蛋白预染Marker附近,也发现了与目的基因蛋白差不多的条带(只能说 差不多,真正的大小有一些偏差) 由于没有纯化,所以条带比较多。+ i" \/ k! u4 b
3 O- F6 g1 X6 h$ z5 C' r+ | F4 \( H于是对蛋白样品做了后续的WB,发现没有目的条带。于是在师兄的建议下,首先用内参跑western blot,又出了新的问题。内参用的是Tublin/ ]) h' T; ~* O C: J2 t
1. 蛋白的提取:首先获取iPS细胞,用上述方法进行裂解 变性。
0 f# F$ ]& R/ M' {6 W: s2.SDS-PAGE电泳:条件浓缩胶 80v 分离胶 120v 恒压,由于考虑到考马斯亮蓝的不可逆性,就想后期做立春红染色,来检测转膜效率。
5 q8 y) x1 a, w" ~3.转膜条件:恒流:120mA(有点不记得了,回去查下,应该差不多) 能 确保在4度下进行 转膜1.5h-2h。结果:发现蛋白预览Marker转到PVDF膜上了,并且很漂亮(亮度 和 各个带之间的距离 及 形状)+ T) V1 A% h. |$ q
4.丽春红染色:用丽春红 染色 发现 无条带,fuck!咨询了一些人,也不知道具体原因,建议往后做
) j% s; b1 Q9 Q5.将丽春红洗干净后,封闭 4度过夜! l! r! G' p% G- \5 t
6.一抗孵育 二抗孵育 暗示中ECL发光试剂显色,发现无结果,··· ··· 失败!: A( [0 B2 n; `
7同时自己也验证了下二抗和发光底物:将发光试剂A和B,各1ml等体积混合,在暗室中加入1ui的二抗,发现有明显的荧光,证明二抗和发光试剂应该都没有问题) m9 k0 \* Q4 F' k3 [ v% r1 J
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实验结果:目的蛋白就不说了,内参的western 也没做出来,都做了一个月了!唉,效率有点低
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不知道在哪出问题了,有点长,有点乱!感谢那些仔细看完帖子的,更感谢那些给出意见的
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