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诱导过程中挑选克隆的标准 与 iPSCs 的传代(有饲养层与无饲养层)   [复制链接]

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楼主
发表于 2014-12-5 10:05 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
最近在做重编程的相关工作,有几个问题一直困扰着我,想请教下!* L0 f8 t9 d2 {' T7 z# X
, V% t4 t$ n4 `/ @( j# ^
1. 自己在试验当中,发现克隆的同步性不是很好,大家是如何确定最佳时间的?刚开始自己是发现有一些克隆就挑选,剩下的继续放入培养箱继续培养,这样的结果往往是克隆摊开(应该是分化),甚至个别孔出现污染(细胞漂浮);
7 n, c# Z/ J# g: `/ E) y
2 z: F. v- i1 m- ^2. 大家是根据什么标准样挑选克隆的?先分享下自己的经验(第一,克隆致密;第二,克隆边缘清晰;第三,克隆未老化;第四,克隆呈现圆形 椭圆形等形状;重要性按照排名先后)额;即使是这样,发现自己的AP阳性率(AP阳性克隆数/克隆数)也不高(10%-20%),且能支持单细胞传代的就更少了,比例差距比较大,有些是挑选几个就出现1个阳性的,有些是挑选30几个才出现一个;效率太低;
+ x" l: L1 g& Q' E+ y* L
- r6 E7 I! r* }& a9 X3 h8 o( b3. iPSCs 传代的问题,不知道大家用的是什么样的方法,是单细胞传代还是克隆传代?希望大家能回复下具体而详细的步骤!先提下自己的疑问:有多大比例的iPSCs 能支持单细胞传代,自己只了解06年 07年的iPSCs,单细胞传代能力还是一个不错的指标;# g$ K3 }! e9 s& N9 `5 Q. E

1 h* j' d. H6 z- d% Y% k4. 在病毒诱导出现克隆后,大家一般是怎么处理的?是手动的挑取克隆,还是用化学的方法进行消化传代····; }: o3 W/ O, q. W
2 s) }7 Q- z; d) l
5. 无饲养层诱导和培养的iPSCs,大家是怎么进行传代的;最近,获得了一孔这样的iPSCs,本来打算扩大培养的,自己就用Tryple 消化的方法收集细胞,并吹打(30下)成单细胞悬液,以便均一的进行扩大培养,不过遗憾的是,细胞就这样无法形成单克隆了;自己推测的问题是,这样的iPSCs 无单细胞传代能力;自己查到了一篇文献,文献上说的比较模糊,只是说手动的挑选克隆进行传代!不知道大家用的是什么方法···. i4 }. h5 `, e8 W: k
7 m7 Y+ `5 o  p: l
补充内容 (2014-12-15 21:46):- X  f) A4 A/ d9 ^5 d/ J
我的QQ:945366086
# o5 N/ @% Z* ?. \- s7 P1 r8 r, E5 z8 F2 l9 s: H' g' c) g7 E
补充内容 (2014-12-22 13:42):4 y* G% J8 E! J/ x6 j4 t
不知道大家怎么消化克隆样的细胞的(主要指那些致密的克隆),自己发现按常规的方法:1个克隆加入300ul tryple 轻轻吹打20-30下,感觉消化不下来(消化下来的细胞很少),也不知道是什么原因,基本排除试剂的原因
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沙发
发表于 2014-12-6 15:53 |只看该作者
“发现克隆的同步性不是很好”,限定因子诱导重编程过程是随机性的,所以每个细胞的重编程进程不一致是正常的,不可能所有的细胞同一个时刻出现克隆。
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Andyhigh + 5 + 2 我很赞同

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藤椅
发表于 2014-12-6 19:37 |只看该作者
回复 zhangweihwz 的帖子; }  |2 B. C& A, @& J

( x3 x+ k+ j- I$ D8 K能帮助解答下其他几个问题嘛,发表点看法也可以哈!

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板凳
发表于 2014-12-8 17:59 |只看该作者
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回答你第四个问题,第一代手动挑取 形态饱满,边缘清晰并且圆形突起的克隆。
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报纸
发表于 2014-12-9 16:24 |只看该作者
唉,我最近也面临这个问题,我开始在饲养层上面挑那种在形态上面看起来很典型的细胞传代,我可不敢打成单细胞,但也没有长起来,有些形态像的不知道是分化了还是本来就不是只是形态像也会分化,不知道是手法还是什么问题,因为后面又发现饲养层支原体污染。
  z( H+ c( f. [- a; F7 y/ O现在无饲养层的也出现克隆了,我正在纠结怎么办,你之前给有一些做过的经验什么的啊?我这次准备活染了去荧光下面挑去。
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地板
发表于 2014-12-9 17:29 |只看该作者
可以发一张你初期克隆的照片吗?我也在养,可是挑克隆是我的痛。我用的是无饲养层,我不知道克隆是由于太密形成的,还是就是诱导而成。当然细胞确实长满了。
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发表于 2014-12-10 17:32 |只看该作者
我最近也在做啊,可以多交流。

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发表于 2014-12-15 21:49 |只看该作者
回复 葱葱 的帖子6 m! W" ^  ]$ t, Y/ k" R
/ D0 b  r" p; a( i4 h3 z% U% K9 p/ {1 m
今天才看到回复,你们可以直接回复我的帖子!
/ ?% I* ^) x  F0 B# k! [4 b+ D# h1 Q3 K" q* R4 P! k, i
你说的用无饲养层 是指全程无饲养层嘛(包括无饲养层诱导和培养iPSCs)
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发表于 2014-12-15 21:49 |只看该作者
回复 陈阳阳 的帖子" _3 f9 D6 E4 f# Z! Q
; \+ }8 l6 s! `% P. E
欢迎多交流!

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发表于 2014-12-15 21:51 |只看该作者
回复 jojo1988509 的帖子
& A- W/ Q( l3 ^$ e' c. H! m5 n% J
也就多挑一些质量好的克隆了,能具体说下活染嘛?
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