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[讨论] 提过组蛋白的请进 [复制链接]

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楼主
发表于 2011-11-25 08:56 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
本帖最后由 xujie158 于 2011-11-25 08:57 编辑 6 {) L; _# @. @& d) ~$ J
6 {) \, R' e% m' c: E
因为第一次提组蛋白histone,有些问题需要跟大家请教一下。
- E& N1 x/ S. b- H# b4 O. A我提完组蛋白,跑了一个SDS-Tris-glycine胶,然后用考马斯亮蓝染色,现在H3、H2B、H2A、H4位置都与其大小相符,唯独H1大小不符,正常约21-22(根据pubmed上公布氨基酸序列计算得到),但从图上看应该在30-32左右,而且是两条带,我又查阅了文献,Nature protocol上的一篇文章显示,其胶图与我的结果一致。5 H5 O/ f/ X+ |) Z1 w$ a, J! H# I
我的条带图
3 O$ y( }: Y% h, C) p Re-exposure of 20111122_1638.jpg-3.gif
0 H( D/ N& c, x+ ]# o* HNature中的条带图# C9 h( M1 P$ ^: |' m' K* R
未命名.JPG + P- j$ Y  W( B9 o2 }1 o& a
现在是请问谁能给我解释一下原因啊?6 X% O' R& F& ?- F. n5 I/ G
我想知道比较确定的回答,如果是回答诸如是不是有修饰啊?是不是有几种不同的type啊?就麻烦大家发个“顶”顶一下就好了,当然如果能够给出具体的原因另当别论。
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沙发
发表于 2011-11-25 09:50 |只看该作者
Histone有乙酰化(acetylation)和甲基化(methylation)修饰,所以不是一条带而且比根据氨基酸序列计算出来的分子量大,你可以用H1抗体做western确认这两条带是不是H1。
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藤椅
发表于 2011-11-25 10:06 |只看该作者
回复 shiyi 的帖子
3 T# Z4 E% ]; p- |% C' I5 W( C8 Q* V! U) b
我查过几篇文献了,结果都是在那个位置,而且都是两条带,现在就是不确定里面具体的原因是什么。
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板凳
发表于 2011-11-25 10:19 |只看该作者
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考虑用专门检测acetylation和methylation的抗体做western检测一下,或者把条带切下来做质谱分析。
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报纸
发表于 2011-11-25 10:36 |只看该作者
组蛋白的大小和他的修饰是密切相关的,我建议你用抗体做一下  ,  你提的应该没有问题
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地板
发表于 2011-11-25 10:40 |只看该作者
给你个提示,有很大程度上,Histone是可以被酶降解的~~
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发表于 2011-11-25 11:21 |只看该作者
回复 eley 的帖子1 v# O* I( T3 `' ~- }" E5 J+ e
8 L# Z9 [" C4 v; _' L; w
已经解决,其实我知道是由于过度修饰造成的,因为只有这样的解释更加合理,但是却一直找不到合适的文献作为支撑,所以请教做过实验的人给出直接的原因,现在已经查到相关文献,附上一条
/ Z: d3 t/ G9 f: p 未命名2.JPG * f0 u& Y; P: H4 h7 ?" q# Y2 k
来源blood
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发表于 2011-11-25 11:22 |只看该作者
谢谢大家讨论

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金话筒 优秀会员

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发表于 2011-11-26 13:56 |只看该作者
求阁下组蛋白提取及WB protocol,包括组蛋白裂解液配方,pvdf膜孔径,转膜电压电流及转膜时间,方便的话在给来点转膜液配方,不胜感激。

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发表于 2011-11-28 08:02 |只看该作者
本帖最后由 xujie158 于 2011-11-28 08:04 编辑 : l' ?+ u* t' R! B/ j( i
6 {0 c2 g0 u$ l
回复 mayansen1314 的帖子
' |0 J. P* P' @4 n2 O3 ?5 m, X
6 }  E0 g4 ?2 X1 P. G/ U+ K不好意思,我们是公司的,可能不能给你有效的帮助信息,因为我们所用到的western试剂都是进口试剂原装的,所以配方我们不需要管的。我感觉如果一般实验室实验的话,不会用到我们使用的试剂,因为价格都比较高,平均我们做一个板的western成本在200元以上,并不适用于高校实验室使用,如果你当真需要的话我可以把商品货号给你。6 D2 X: f! C1 d4 E& D) t0 [9 t
我们转膜的话用的是半干转,似乎也不符合你的要求。
" L2 s3 P7 Z& b# e: ?你可以网上搜索一下,信息很多的。
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