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楼主: plando
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如何用PCR扩增长的片段   [复制链接]

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11楼
发表于 2014-2-27 22:10 |只看该作者
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回复 weiyepan 的帖子
( c0 @0 a, H% v; P2 A# w6 }3 K/ v$ L* i4 m) W) N) ~
你好,想问一下第三条中“逆转录文库”指的是不是cDNA?

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12楼
发表于 2014-3-1 01:14 |只看该作者
回复 weiyepan 的帖子) V9 l3 z6 @7 G3 U$ a2 ^- l, r
+ K% b1 J, K6 r7 O0 a) R) x
长片断是在基因组或者是逆转录文库里面是什么意思? 这些不好做, 那在其他什么情况好做呢? 谢谢!

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13楼
发表于 2014-3-4 08:59 |只看该作者
回复 chenhuachen 的帖子; m4 [& q! Q1 i6 p8 [4 T; O! t; {

; ?& a2 v9 ^  S是的

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14楼
发表于 2014-3-4 09:03 |只看该作者
回复 julia20 的帖子! n3 u3 n, d" o  e+ r1 S
/ l* u# M/ n" Z3 D2 e
cDNA一般很少能转到5k以上的,一则反转的体系不行,二则常温合成RNA的二级结构影响很大。基因组用Taq好扩,这是公认的,而长片段Taq又容易引入突变,所以在基因组里面拿长片段不太实际,只能分段扩。
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15楼
发表于 2014-3-4 10:34 |只看该作者
7KB 不是非常长 可以直接做的 不用桥接
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16楼
发表于 2014-3-11 09:30 |只看该作者
7kb不算太长,你可以在NEB, TAKARA等公司选择他们的长片段PCR酶来扩增,引物设计按他们的推荐要求来就可以了,简单的很,不过模板质量要求要高,呵呵
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17楼
发表于 2014-3-13 19:37 |只看该作者
公司有卖专门扩长片段的酶和buffer,注意dNTP的量要相对增加
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18楼
发表于 2014-3-14 11:23 |只看该作者
用KOD高保真酶,不用桥连,直接P就可以。如果条带不特异或者不亮,可以梯度PCR摸一下最适退火温度,循环数不用太多,延伸时间要足够
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19楼
发表于 2014-3-21 19:48 |只看该作者
回复 weiyepan 的帖子9 [3 x% Q2 @/ s( Z' i! i1 g
' o6 d7 Q# }: q! _; ]
你好,想请教一下:我最近在扩TP53的全长,用tiangen的hotstart taq酶扩增后条带很弱,怎么办?是taq酶的问题吗?另外最底下的引物二聚体比较亮
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20楼
发表于 2014-3-22 12:21 |只看该作者
加点betaine,初始模板多加点,循环数+5
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