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楼主: safflower
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[讨论] qRT-PCR结果分析   [复制链接]

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包包
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优秀会员 帅哥研究员 美女研究员 小小研究员 金话筒

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发表于 2012-3-5 11:16 |只看该作者
回复 safflower 的帖子- r: \9 o; j" u# M* f& \
: A3 k5 @8 ^' C* |& C
首先需要realtime的实验重复。如果还是不行的话,你可以重新抽提RNA,反转录。
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发表于 2012-5-6 14:38 |只看该作者
回复 sj03572001 的帖子/ ?1 m, Z/ h& d+ C- N4 ^
% v1 h( V* J( u. a
定量PCR确实纠结,我做mIRNA的定量重复性不高,一会上调一会下调,肿么办啊~!
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发表于 2012-5-7 22:42 |只看该作者
q-PCR的结果肯定比普通PCR的结果靠谱,重现性也要好.你的问题可能是操作or机器的问题.溶解曲线好不好只能说明你的产物的特异性,具体量的差异还得看Ct值.你确定做的是绝对定量?一般实验室的qPCR都做不到决定定量,首先是需要Taqman探针,再者需要构建质粒,根据质粒的copy数绝对定量.
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发表于 2012-5-8 20:05 |只看该作者
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谢谢!

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发表于 2012-5-8 20:05 |只看该作者
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发表于 2012-5-8 21:46 |只看该作者
回复 safflower 的帖子$ O( G& A* ?0 k

3 S4 {0 G8 G% N0 w0 x9 `) P; u对于Real Time PCR,你要确定你的对比基因的GAPDH差异不是很大,要不然GAPDH差异过大,会造成分析数据的不准确。( k5 v; b  n2 i3 Q6 U' Q
对于单纯的电泳,首先要看低循环数下GAPDH是否一致,如果循环数过多,会掩盖GAPDH之间的差异。其次要看你的目的条带的循环数,如果循环数过多也会掩盖真实的基因表达情况。
/ @% `! B- S( X一般Real Time PCR的循环数都较多,如果是用Real Time PCR的产物进行电泳的话,结果一般会一样。但是一般不建议用该产物进行电泳,因为同普通的电泳相比,程序是不一样的。而且Real Time PCR的分析结果显示的是初始细胞中基因RNA的表达情况,而电泳结果则显示的是体外循环之后的结果。5 e% A+ D  R, K+ \! c
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发表于 2012-5-9 08:58 |只看该作者
OK,thank you!

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发表于 2012-5-9 09:10 |只看该作者
哎!一定要注意个人操作!建议你去看看关于如何做好Qpcr的相关资料,要尽可能的降低主观因素带来的影响!降低由试管效应带来的误差。
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发表于 2012-5-9 13:25 |只看该作者
加样的过程,注意些加样的细节吧,毕竟每一种的加样量很少啊。不知道你们做real time-PCR的终体积是多少啊?还有,建议样本最好放在仪器的正中央。跑电泳时,建议加样量取相同的值,以免有的多,有的少,影响实验结果。
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发表于 2012-5-16 22:54 |只看该作者
回复 frankieisme 的帖子
8 ~# U6 p9 @- F7 p) |; i3 n! j" G% C" q/ ~! {6 \: {. m( B
根据质粒作为标准合适吗?质粒的扩增效率比较高,结果不见得可行。我试过用基因组作标准和质粒作标准,从结果看用基因组比较可靠。
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