|
 
- 积分
- 955
- 威望
- 955
- 包包
- 755
|
本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑 0 U% Q k2 T# _& q. e7 \6 b9 I, N
/ g$ {/ Z _ D% |6 w V这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。# I; Y5 B- N! r' R4 E+ X
我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。
; Z' M( x6 _ ^( O6 zTESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
! n% J- @& R. K最简单的用法如下
9 D0 H! j( q: o7 L8 C |# q如图1：打开网址后，点击 site search! Q; E- a0 L- {; W. i
如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit- t. Q+ b( G2 \9 j
如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。
: j3 I# x) }1 {) C$ L7 v如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。4 ~; L% z W2 X) O2 B6 l
3 Q \- t; ^% v F
其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
-
总评分: 威望 + 30
包包 + 50
查看全部评分
|
发表于 2011-9-12 21:49
