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楼主: safflower
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[讨论] qRT-PCR结果分析   [复制链接]

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包包
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优秀会员 帅哥研究员 美女研究员 小小研究员 金话筒

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发表于 2012-3-5 11:16 |只看该作者
回复 safflower 的帖子' g9 {! C" K! E9 |
" k  b" ^+ Z# J, q4 H/ t$ J
首先需要realtime的实验重复。如果还是不行的话,你可以重新抽提RNA,反转录。
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发表于 2012-5-6 14:38 |只看该作者
回复 sj03572001 的帖子
0 w+ z& Z+ }, T9 M
  O7 ]+ J7 O- Q. |定量PCR确实纠结,我做mIRNA的定量重复性不高,一会上调一会下调,肿么办啊~!
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发表于 2012-5-7 22:42 |只看该作者
q-PCR的结果肯定比普通PCR的结果靠谱,重现性也要好.你的问题可能是操作or机器的问题.溶解曲线好不好只能说明你的产物的特异性,具体量的差异还得看Ct值.你确定做的是绝对定量?一般实验室的qPCR都做不到决定定量,首先是需要Taqman探针,再者需要构建质粒,根据质粒的copy数绝对定量.
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发表于 2012-5-8 20:05 |只看该作者
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谢谢!

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发表于 2012-5-8 20:05 |只看该作者
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发表于 2012-5-8 21:46 |只看该作者
回复 safflower 的帖子' E- ]! \* b" Q6 o* d# h0 U

7 r! X5 h! j7 V7 k7 j对于Real Time PCR,你要确定你的对比基因的GAPDH差异不是很大,要不然GAPDH差异过大,会造成分析数据的不准确。
% A8 g6 i$ k1 c8 S2 P对于单纯的电泳,首先要看低循环数下GAPDH是否一致,如果循环数过多,会掩盖GAPDH之间的差异。其次要看你的目的条带的循环数,如果循环数过多也会掩盖真实的基因表达情况。
" F  K0 y$ r4 M2 ^一般Real Time PCR的循环数都较多,如果是用Real Time PCR的产物进行电泳的话,结果一般会一样。但是一般不建议用该产物进行电泳,因为同普通的电泳相比,程序是不一样的。而且Real Time PCR的分析结果显示的是初始细胞中基因RNA的表达情况,而电泳结果则显示的是体外循环之后的结果。
4 B3 k! J3 h9 O/ h' T8 Z
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发表于 2012-5-9 08:58 |只看该作者
OK,thank you!

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发表于 2012-5-9 09:10 |只看该作者
哎!一定要注意个人操作!建议你去看看关于如何做好Qpcr的相关资料,要尽可能的降低主观因素带来的影响!降低由试管效应带来的误差。
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发表于 2012-5-9 13:25 |只看该作者
加样的过程,注意些加样的细节吧,毕竟每一种的加样量很少啊。不知道你们做real time-PCR的终体积是多少啊?还有,建议样本最好放在仪器的正中央。跑电泳时,建议加样量取相同的值,以免有的多,有的少,影响实验结果。
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发表于 2012-5-16 22:54 |只看该作者
回复 frankieisme 的帖子3 S* u/ A' c; f* I- g3 i

( d7 z3 P8 v/ |1 T# p3 y) Y根据质粒作为标准合适吗?质粒的扩增效率比较高,结果不见得可行。我试过用基因组作标准和质粒作标准,从结果看用基因组比较可靠。
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