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本人最近的试验遇到一些问题,望各位战友能多提宝贵意见。
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自己想获得几种目的蛋白(四因子OSKM蛋白),做一些蛋白的功能试验。正在用pET-28a表达系统(一种常见的成熟的原核表达系统)表达目的蛋白(OSKM),前期已成功获得了pET28a+目的蛋白基因 的质粒,转化到BL21感受态中,经IPTG诱导表达后,想验证诱导表达是否成功了,遂做了一个Western Blot。由于第一次做WB,走了不少弯路。结果和过程如下:# M; m; |6 J m6 ^% E
U" ?5 N: J- c- \1.蛋白的提取:第一次发现提取的菌体过多,裂解液加的不是很多,可能存在裂解不充分的可能。第二次减少了菌液的用量,加了足够的裂解液,进行了充分的裂解。
+ [7 F' R' i% I* U 备注:裂解液是碧云天的,主要是用来裂解细 胞的,后期考虑用超声波裂解的方法。裂解液中加入了PMSF3 d5 W8 R, a+ `3 ^* T( @9 D! k
疑问:裂解后的菌液,经离心取上清,发现上清很清亮。裂解的整个过程中也没有发现粘稠状的液体,这正常嘛,不是说可能有DNA嘛???. t7 ~/ J# O% Z5 \
2.蛋白的变性:加入蛋白上样缓冲液,并在沸水浴中加入5分钟。
: _3 h+ {; K/ X 疑问:我看有些地方是加热10分钟,想问下这个可影响后面的结果???
0 D2 i7 G& ~2 \% t, q3 L" K x3.SDS-PAGE:首先对上述样品跑了一个SDS-PAGE,进行考马斯亮蓝染色。染色的结果发现有很多的条带,在蛋白预染Marker附近,也发现了与目的基因蛋白差不多的条带(只能说 差不多,真正的大小有一些偏差) 由于没有纯化,所以条带比较多。
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- D: P5 }9 p6 Z, X g于是对蛋白样品做了后续的WB,发现没有目的条带。于是在师兄的建议下,首先用内参跑western blot,又出了新的问题。内参用的是Tublin
& y$ [0 j% H) z( K% K7 N1. 蛋白的提取:首先获取iPS细胞,用上述方法进行裂解 变性。" Q! {$ Q# b2 {2 G& O3 W: ?9 [- I
2.SDS-PAGE电泳:条件浓缩胶 80v 分离胶 120v 恒压,由于考虑到考马斯亮蓝的不可逆性,就想后期做立春红染色,来检测转膜效率。& |! U3 V1 x" P" c- ^9 B; n
3.转膜条件:恒流:120mA(有点不记得了,回去查下,应该差不多) 能 确保在4度下进行 转膜1.5h-2h。结果:发现蛋白预览Marker转到PVDF膜上了,并且很漂亮(亮度 和 各个带之间的距离 及 形状)7 R4 v }8 k) c2 `
4.丽春红染色:用丽春红 染色 发现 无条带,fuck!咨询了一些人,也不知道具体原因,建议往后做+ _6 n* X: D4 X0 h; P( H, G4 P, g
5.将丽春红洗干净后,封闭 4度过夜( k5 f: X* S$ o* ^( K" S M
6.一抗孵育 二抗孵育 暗示中ECL发光试剂显色,发现无结果,··· ··· 失败!
; I0 E% g* u; J7同时自己也验证了下二抗和发光底物:将发光试剂A和B,各1ml等体积混合,在暗室中加入1ui的二抗,发现有明显的荧光,证明二抗和发光试剂应该都没有问题: n4 U; s& w! c" q" Q
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实验结果:目的蛋白就不说了,内参的western 也没做出来,都做了一个月了!唉,效率有点低
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9 S7 p3 B" D4 T$ k$ s. ?/ G不知道在哪出问题了,有点长,有点乱!感谢那些仔细看完帖子的,更感谢那些给出意见的& E# d( m4 S" A( m
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