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本人最近的试验遇到一些问题,望各位战友能多提宝贵意见。
7 x; b3 B2 v* E- R+ x1 { B7 h9 b8 b
8 p& F1 ~. G% ?; a& m自己想获得几种目的蛋白(四因子OSKM蛋白),做一些蛋白的功能试验。正在用pET-28a表达系统(一种常见的成熟的原核表达系统)表达目的蛋白(OSKM),前期已成功获得了pET28a+目的蛋白基因 的质粒,转化到BL21感受态中,经IPTG诱导表达后,想验证诱导表达是否成功了,遂做了一个Western Blot。由于第一次做WB,走了不少弯路。结果和过程如下:1 V1 E+ Z( \+ x4 X6 N' P
4 s9 q, G+ o; h1 x v1.蛋白的提取:第一次发现提取的菌体过多,裂解液加的不是很多,可能存在裂解不充分的可能。第二次减少了菌液的用量,加了足够的裂解液,进行了充分的裂解。, u v0 q/ m$ Z! H I+ ?8 e
备注:裂解液是碧云天的,主要是用来裂解细 胞的,后期考虑用超声波裂解的方法。裂解液中加入了PMSF
5 h' n- Q. C8 @7 O$ G 疑问:裂解后的菌液,经离心取上清,发现上清很清亮。裂解的整个过程中也没有发现粘稠状的液体,这正常嘛,不是说可能有DNA嘛???
2 y% n$ |' ~% f) y& c4 I0 k2.蛋白的变性:加入蛋白上样缓冲液,并在沸水浴中加入5分钟。
2 z% k" e3 {+ A! D3 L8 J$ ?( d$ { 疑问:我看有些地方是加热10分钟,想问下这个可影响后面的结果???7 W* \7 {( \$ L1 ?: {6 K1 x4 [3 }
3.SDS-PAGE:首先对上述样品跑了一个SDS-PAGE,进行考马斯亮蓝染色。染色的结果发现有很多的条带,在蛋白预染Marker附近,也发现了与目的基因蛋白差不多的条带(只能说 差不多,真正的大小有一些偏差) 由于没有纯化,所以条带比较多。
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P, l: b( a# R, s# a! @于是对蛋白样品做了后续的WB,发现没有目的条带。于是在师兄的建议下,首先用内参跑western blot,又出了新的问题。内参用的是Tublin
7 d D3 [# g# S9 l$ H4 @/ m+ _1. 蛋白的提取:首先获取iPS细胞,用上述方法进行裂解 变性。
P0 f& o9 q" P4 P e, K. Y. T2.SDS-PAGE电泳:条件浓缩胶 80v 分离胶 120v 恒压,由于考虑到考马斯亮蓝的不可逆性,就想后期做立春红染色,来检测转膜效率。
' P2 G2 x0 m0 v5 O3.转膜条件:恒流:120mA(有点不记得了,回去查下,应该差不多) 能 确保在4度下进行 转膜1.5h-2h。结果:发现蛋白预览Marker转到PVDF膜上了,并且很漂亮(亮度 和 各个带之间的距离 及 形状)
6 u$ e# S9 t) d$ \* Y: U4.丽春红染色:用丽春红 染色 发现 无条带,fuck!咨询了一些人,也不知道具体原因,建议往后做7 v4 q; i9 ?( F5 j; q" y+ j/ ^
5.将丽春红洗干净后,封闭 4度过夜
8 B% x0 e3 p, g+ _0 z* j3 Q6.一抗孵育 二抗孵育 暗示中ECL发光试剂显色,发现无结果,··· ··· 失败!: O; b' q$ G$ W; U0 b) C. q
7同时自己也验证了下二抗和发光底物:将发光试剂A和B,各1ml等体积混合,在暗室中加入1ui的二抗,发现有明显的荧光,证明二抗和发光试剂应该都没有问题
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实验结果:目的蛋白就不说了,内参的western 也没做出来,都做了一个月了!唉,效率有点低$ e5 X+ B/ e/ C/ ~
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不知道在哪出问题了,有点长,有点乱!感谢那些仔细看完帖子的,更感谢那些给出意见的+ r9 m5 A S6 G# b8 G
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